m6A修飾圖譜構建及作用機制:通過m6A甲基化測序(MeRIP-Seq,miCLIP)構建疾病細胞模型或者發病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數量及分布,Peak關聯基因的特征,聯合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1,通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節,作者研究了FOXM1的鄰近基因,發現lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補,且共表達、共定位,進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發生。傳統的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質重構。近。細胞是生命的基本單位,所有生物體都是由一個或多個細胞組成的。下面就跟著上海東寰一起看看吧。上海疾病模型科研技術服務外包
圖2MAZTER-Seq實驗流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下,檢測到的剪切效率高于野生型(剪切效率高低m6A水平),m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠,那檢測的特異性位點是否準確呢?作者也將該方法檢測到的新甲基化位點使用放射標記層析檢測,發現預測的位點準確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中,作者則是與m6A抗體IP的方法進行了比較,也證實了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結果驗證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外,后文中作者也在大規模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態和酵母減數分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統;并進一步通過這一方法檢測了哺乳動物不同細胞間m6A水平的保守性;也探究了去甲基化酶FTO對整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術,其他部分暫不過多分析了。新的技術能拓展我們的研究內容;對于這一技術。山西小鼠科研技術服務服務科研小白如何摸索自己的預實驗。
膿毒癥動物模型必須具備以下基本要素:有膿毒癥典型的高排低阻血流動力學表現和高代謝狀態;伴發多個功能障礙;有較高的自然死亡率,根據膿毒癥的轉歸,要求動物模型的自然死亡率達到50%~70%;膿毒癥是嚴重引起機體的炎癥反應過度造成的自身損傷,不是細菌和內對機體的直接損傷,故出現功能障礙及動物死亡距膿毒癥模型制備應有一定的時間間距。一般在制模后6~12h后發生的功能障礙或死亡屬全身炎癥反應所致。實驗動物的選擇在制作動物模型時多選用雄性小鼠,因為雌性小鼠較雄性小鼠更能耐受膿毒癥和失血性休克,且進入發期的雌性小鼠性水平變化很大,而雄性小鼠在膿毒癥時更易于發生免疫抑制。為什么選擇CLP模型?盲腸結扎穿孔模型(CLP)模型是接近于人類膿毒癥機制的模型,被稱為膿毒癥模型的“金標準”。CLP技術在20世紀70年代被建立。CLP模型非常適宜用于防治膿毒癥或膿毒性休克新藥的臨床前觀察造模方法CLP膿毒癥模型的建立主要分為兩個階段:盲腸遠端結扎和盲腸穿刺。首先是手術引發的結扎部位組織變性壞死引起局部炎癥反應,其次是穿孔后使糞便內容物漏入腹膜引起多菌性細菌性腹膜炎,進而誘發全身性炎癥反應。
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用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選(細胞水平的結合和阻斷)、CAR分子的殺傷活性評價。材料與儀器(以慢pMSCV載體為例)包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質粒、GAG質粒、VSV質粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構建1)根據目的基因mRNA編碼區設計引物,分別在引物兩端加入酶切位點EcoRI和BglII。2)從細胞中提取目的基因mRNA,然后逆轉錄成cDNA,然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區擴增出來。PCR擴增出帶有酶切位點的目的基因編碼區序列,連接至pMD19-T載體后轉化至感受態DH5α,分別進行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列,電泳割膠回收純化,連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉化到感受態DH5α,菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后,送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后,將質粒轉化至感受態DH5α中,并進行無內質粒抽提。GAG質粒和VSV質粒同樣可以轉化至感受態DH5α中,并進行無內質粒抽提。質粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養基培養6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。由于大部分研究使用到的是人類來源的細胞,種植到免疫正常的動物體內會發生免疫排斥反應。貴州乳鼠科研技術服務構建
常見的5種實驗動物取血方式,你掌握幾種?上海疾病模型科研技術服務外包
用伊紅乙醇液對比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀察在鏡下可見卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細胞或單層立方上皮,卵巢實質分為皮質和髓質??梢娚掀?,原始卵泡和生長卵泡。卵巢組織中各發育階段卵泡及卵巢基質的形態結構清晰可見,細胞核呈藍紫色,細胞質及間質成分呈淺紅色,卵泡中卵母細胞、卵泡細胞、透明帶均清晰可見。注意事項1.取材注意事項(1)取材動作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細胞的成分、結構等發生變化。(2)切片材料應根據需要觀察的部位進行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會發生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時就沒有作用了。(3)固定材料時,固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。上海疾病模型科研技術服務外包