羅丹明屬于呫噸族。與市場上的許多其他染料相比，羅丹明具有出色的光穩定性以及許多光物理特性，使其非常適合用作激光染料、熒光探針和顏料。它們在聚合物納米粒子表面的表征、聚合物-生物偶聯物的檢測、活細胞的成像以及寡核苷酸在膠乳上的吸附分析等方面特別有用。羅丹明熒光染料的衍生物也用作：分子開關，病毒表面修飾，化學傳感器，硫醇。不同類型的染料通過它們各自的取代基（R1、R2、R3、R4和G）來區分。由于它們的差異，這些熒光染料在溶液中也表現出不同的光物理特性（例如不同的熒光壽命和發射比較大值）。氨基被剛性化的羅丹明染料無論溫度范圍如何都表現出高量子產率，而在每個氮處具有兩個烷基取代基的那些表現出活化的內部轉化，量子產率和熒光壽命隨溫度的變化而變化。羅丹明101和羅丹明B是一些**常用的羅丹明染料具有以下特點：--羧基傾向于在酸性溶液中質子化--染料轉化為兩性離子堿性溶液--兩性離子染料在極性較小的有機溶劑中變為無色內酯要將羅丹明用作熒光探針，必須對其進行修改。這可以通過(thexanthenemoiety)氨基、羧基苯基環或羧酸基團的修飾來實現。與TRITC一樣，羅丹明(NHS-rhodamine)的熒光特性為544nm（比較大吸收波長）和576nm（比較大發射）。D-熒光素（D-Luciferin）是螢火熒光素酶底物，其量子效率為0.88，是Luminol的20倍。廣西熒光染料luciferin

熒光染料:能發出熒光的染料。在吸收紫外線或可見光后，能把短波長的光轉變為波長較長的可見光波而反射出來，呈閃亮的鮮艷色彩。例如，酸性曙紅、熒光黃、紅汞以及某些分散染料等。它們大多是含有苯環或雜環并帶有共軛雙鍵的化合物。熒光染料可以單獨使用，也可以組合成復合熒光染料使用。其中復合熒光染料是利用熒光共振能量轉移技術合成的熒光染料，由距離非常近、能量可以在彼此間傳遞的一個供體及一個受體熒光物分子所組成。復合染料在受體分子的激發波長被激發，在供體分子的發射波長發射一個光子。熒光染料發展非常迅速，已開發的用于科研和臨床應用的熒光染料已基本覆蓋了由紫外到可見光及紅外的整個光譜范圍。廣東免疫熒光熒光染料PI常用于細胞凋亡(apoptosis)或細胞壞死(necrosis)的檢測，常用于流式細胞儀分析。

在1990年代***使用的綠色熒光蛋白（從水母維多利亞水母克隆）及其衍生物（例如藻紅藍蛋白、藻膽蛋白和藻紅蛋白等）是當今生物學研究中**常用的一些生物熒光團。雖然熒光團可用于在細胞、細菌和各種***中表達質粒，但它們的使用有一些缺點，即它可能很耗時，并且在融合時還能夠改變某些細胞蛋白的正常生物學功能。此外，與許多其他熒光團相比，生物熒光團的光穩定性和靈敏度較低。綠色熒光蛋白(GFP)綠色熒光蛋白是當下流行的生物熒光團之一，由238個氨基酸組成，其中三個負責發出可見綠色熒光的結構。在水母本身中，熒光團與水母發光蛋白（一種蛋白質）相互作用，當添加鈣時會發出藍光。通過DNA重組，研究人員可以使用負責產生蛋白質的基因來研究給定的基因和蛋白質。在這里，在將復合物插入細胞之前，該基因與另一個基因（負責產生所需蛋白質的第二個基因）結合。如果細胞產生綠色熒光，研究人員就可以明顯看出該細胞能夠表達目標基因。GFP由488nm激光線激發，可在510nm處檢測。來自熒光團的微弱信號可以使用抗GFP抗體放大。作為生物標記物，綠色熒光蛋白用于以下功能：監測各種生理過程*識別蛋白質定位*檢測轉基因表達

蛋白熒光標記技術是目前**為常見的蛋白體外標記技術，利用級聯放大反應原理，將極度敏感性且易于檢測的熒光素通過某個基團吸附或共價結合后，標記到特異性抗原或抗體分子上，應用熒光顯微鏡觀察熒光標記物因增強放大效應而產生顏色、光譜等變化，以分析示蹤相應抗體或抗原性質與含量的方法。該技術在具有高度精確性的熒光顯微鏡下，借助高度靈敏性的熒光檢測，在各種生物過程中對目的蛋白進行可視化，從而通過抗原抗體高度特異性免疫定量表達或在細胞研究中定位。蛋白熒光標記已成為研究蛋白質互作、酶活性、***示蹤以及細胞分選重要工具。蛋白標記常用熒光染料隨著蛋白熒光標記技術不斷發展，各類熒光素廣泛應用于生物實驗中，目前常用標記蛋白/抗體的熒光素主要有BODIPY類、香豆素類、羅丹明類、近紅外類、NBD胺類以及菁染料等。南京星葉生物科技有限公司提供多種性價比高的各類活化熒光素，其熒光染料覆蓋波長范圍從350nm到790nm，例如Cy系列、SuperFluor系列（效果同AlexaFluor系列）等，用于標記抗體、多肽以及蛋白功能基團，繼而生成分子探針，通過熒光成像進行相應檢測。南京星葉生物提供多種性價比高的各類活化熒光素，例如Cy系列、Super Fluor 系列（效果同Alexa Fluor系列）等。

藻紅蛋白-藻紅蛋白(PE)是一種紅色蛋白色素復合物，屬于藻膽蛋白家族。它可以在紅藻和隱植物中找到，它作為葉綠素色素的附屬物。在生物科學中，熒光團可以與蛋白質結合，例如用于抗原檢測的抗體等，因為它能夠發出明亮的熒光。由于熒光團往往會很快發生光漂白，因此很少在熒光顯微鏡中使用。它經常用于流式細胞術。※別藻藍蛋白(APC)-與藻紅蛋白一樣，別藻藍蛋白也屬于藻膽蛋白家族，是從紅藻中分離出來的。在594和633nm的激光線激發下，熒光團的比較大吸光度在650nm處，而熒光發射峰在66nm處。與熒光素偶聯物相比，熒光團的靈敏度已顯示高5至10倍，并具有許多其他有益特性，包括大斯托克斯位移、高水溶性、長波長發射和耐猝滅。雖然別藻藍蛋白通常不用于需要光穩定性的應用，但它***用于流式細胞術、ELISA、微陣列等過程以及各種依賴高靈敏度的應用。PI是一種可對DNA染色的細胞核染色試劑，它在嵌入雙鏈DNA后釋放紅色熒光。廣西熒光染料luciferin

目前常用標記蛋白/抗體的熒光素主要有BODIPY類、香豆素類、羅丹明類、近紅外類、NBD胺類以及菁染料等。廣西熒光染料luciferin

在熒光顯微術中，不僅蛋白質結構感興趣，而且對核酸也感興趣。有時有必要通過檢測細胞核來確定細胞的確切位置或數量。最常見的DNA染色劑之一是DAPI（4',6-二氨基-2-苯基吲哚），主要與DNA雙螺旋富含A-T的區域結合。與未結合態相比，DAPI在DNA上的熒光強度增加。染料被UV（紫外線）光激發，比較大激發波長為358nm。發射光譜較寬，峰值在461nm。弱熒光也可以檢測到RNA結合。在這種情況下，發射轉移到500nm。有趣的是，DAPI能夠滲透完整的細胞膜。因此，該染料既可用于固定細胞也可用于活細胞。廣西熒光染料luciferin