多序列比對的意義：用于描述一組序列之間的相似性關系，以便了解一個基因家族的基本特征，尋找motif，保守區域等。用于描述一個同源基因之間的親緣關系的遠景，應用到分子進化分析中。多序列比對的方法：同源性分析中常常要通過多序列比對來找出序列之間的相互關系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比對大多都是采用全局比對的算法。這樣對于采用計算機程序的自動多序列比對是一個非常復雜且耗時的過程，特別是序列數目多，且序列唱的情況下。多重PCR是降低長片段PCR擴增成本的有效方式。浙江高同源區段分型

理論上講，SNP既可能是二等位多態性，也可能是3個或4個等位多態性，但實際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。因此，通常所說的SNP都是二等位多態性的。這種變異可能是轉換（C T，在其互補鏈上則為G A），也可能是顛換（C A，G T，C G，A T）。轉換的發生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點。轉換的幾率之所以高，可能是因為CpG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中，易發生突變的位點，其中大多數是甲基化的，可自發地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發生變異，因此SNP既有可能在基因序列內，也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說，位于編碼區內的SNP（coding SNP,cSNP）比較少，因為在外顯子內，其變異率*及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關注。南京高同源序列分型分析由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.

隨著二代測序技術的普及，相比Sanger測序，以降低測序讀長的前提，**增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型，不僅測序讀長滿足分型需求，可以同時對數十數百個位點，上千樣本進行分型。該方法相比直接測序法，除了保留測序法的優點外，彌補了其通量不足的限制，二代測序分型法也正在快速在領域內推廣。上海翼和生物提供高同源SNP分型服務，無錫分公司（無錫翼和應用生物技術有限公司）地址:無錫市濱湖區梅梁西路138號七號樓一樓。

1. SNP數量多，分布比較常見。據估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中，根據SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規模化篩查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態的標記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標準曲線，然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較，根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態性，也有利于對其進行基因分型。SNP分型遇到高同源區段怎么辦？翼和生物自主研發多重長片段巢式PCR技術，解決高同源區段SNP分型難題。

①所謂同源區段,就是針對一對同源染色體,兩條同源染色體上的相同位置的一個區段就是同源區段,對不對?對；②然后同源區段和等位基因有什么區別聯系?同源區段可以當做同源染色體來理解,那么上面就有等位基因；③是不是如果一個染色體沒有某個同源區段的話,那就是說他沒有該性狀等位基因?是的。翼和生物研發和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術和產品，逐步形成了在細胞組織和動物模型質控、大健康檢測和科學研究3大板塊產品布局。我們在SNP分型時需要的時等為同源序列變異SNPs。北京高同源SNP分型怎么解決

高同源區段是二倍體和多倍體都存在的，由于多倍體染色體加倍，所以高同源區段在多倍體中更是普遍現象。浙江高同源區段分型

主要是指同源蛋白質的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進行對比，比對出其相似的程度。相似度越高，說明序列的同源性越高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位，至今已有十六年歷史，專注于為國內科研工作者和生物醫藥企業提供各類分子遺傳學技術服務和質控試劑盒。基于自主知識產權的多重PCR技術，翼和生物研發和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術和產品，逐步形成了在細胞組織和動物模型質控、大健康檢測和科學研究3大板塊產品布局。浙江高同源區段分型

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