上海翼和生物甲基化測序采用的是重亞硫酸鹽擴增子測序法（Bisulfite Amplicon Sequencing， BSAS），重亞硫酸鹽轉化是研究DNA甲基化的金標方法，該技術基于非甲基化胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的化學轉化，即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA，非甲基化胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化胞嘧啶不發生這種轉化，從而能夠在單核苷酸水平上確定DNA甲基化（圖1）。轉化后的序列可以進行多種分析，包括重亞硫酸鹽測序、焦磷酸測序、甲基化特異性PCR、高分辨率熔解曲線分析、基于微陣列的方法和下一代測序。Hi-Methylseq方案一次測序反應每個位點測序上百次節約時間、成本、定量準確。廣州目標位點甲基化重測序怎么解決

全基因組甲基化測序結合了亞硫酸氫鹽轉化（bisulfiteconversion）方法與新一代高通量測序技術，可在單堿基分辨率水平上高效地檢測全基因組DNA甲基化狀態。亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，PCR擴增所需片段，則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。對PCR產物進行高通量測序，與參考序列比對，即可判斷CpG/CHG/CHH位點是否發生甲基化。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位，上海市****，至今已有16年的歷史。江蘇bisulfite甲基化重測序準確度高機體細胞在經歷脅迫、創傷等環境變化后，會產生特定的應答，并往往會用DNA甲基化記錄在DNA修飾中。

亞硫酸氫鈉修飾后測序法是一種對DNA進行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應擴增與DNA測序相結合的方法，能夠提供測定區域的序列信息，準確定位甲基化胞嘧啶位點；重亞硫酸鹽修飾后，甲基化胞嘧啶保持不變，但非甲基化胞嘧啶轉變為尿嘧啶，PCR擴增后為胸腺嘧啶，其將甲基化狀態的差異轉化成堿基的差異，從而對胞嘧啶的甲基化狀態進行分析；但在亞硫酸鈉處理的酸性環境下，單鏈特異性PCR模板穩定性下降，容易降解；并且模板鏈CG二核苷酸水平高易形成復雜的二級結構，常出現非特異性條帶，結合“巢式PCR法”能明顯提高擴增的特異度。

DNA甲基化即在DNA上增加甲基基團，是使基因的轉錄抑制或沉默的主要方式。該修飾特異性地發生在CpG位點，胞嘧啶通過磷酸鹽與鳥苷酸連接(圖1)。甲基基團的插入改變了DNA的表觀和結構，可能會直接阻礙DNA的識別及與轉錄因子的結合，或者吸引其他因子優先與DNA結合，干擾轉錄因子的結合。目前已鑒定了三個與甲基化DNA結合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso樣蛋白、以及SRA蛋白。通過招募這些蛋白，DNA甲基化可促進某些組蛋白狀態的維持，如去乙酰作用，從而保持轉錄后的組蛋白修飾。例如，MBD家族的甲基CpG結合蛋白2(MeCP2)與甲基CpG結合，招募HDACs，可促使染色體濃縮和轉錄抑制。如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或tumour,而且,生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。

DNA甲基化屬于表觀遺傳的范疇。表觀遺傳屬于一種可以對環境產生應答和改變的遺傳機制。機體細胞在經歷脅迫、創傷等環境變化后，會產生特定的應答，并往往會用DNA甲基化、組蛋白修飾等形式將應激的模式記錄在DNA修飾中。這種脅迫記憶可以幫助細胞在面臨下一次應激的時候快速適應。同時，這種表觀修飾可以通過遺傳的方式傳遞給下一代細胞。對于高等動植物，通常壽命都比較漫長。在漫長的一生中，一方面機體會經歷大量的環境應答，另一方面細胞將會分裂多代。那么機體就更需要將應答的信息，存儲在DNA甲基化中傳遞給后代的細胞，以提高這個物種的環境適應能力。亞硫酸氫鹽處理是一種分類5-甲基胞嘧啶和非甲基化堿基的有效方法之一。成都CPG島甲基化重測序準確度高

這種DNA修飾方式在不改變基因序列前提下實現對基因表達的調控。廣州目標位點甲基化重測序怎么解決

DNA甲基化可以抑制基因表達。其機制是當DNA甲基化出現在啟動子區，其會強化啟動子序列的異染色質化（染色體擰巴在一起），而使轉錄起始復合物無法接近和結合，從而強化基因的轉錄抑制。只有保持開放性常染色質狀態的轉錄起始位點，才能保證轉錄起始蛋白復合物可接近并結合這個區域，從而保證基因的轉錄表達。當DNA甲基化出現在編碼基因不同區域的時候（上游，基因區或下游），其對基因表達的影響也是不同的。同時，DNA甲基化不僅只影響基因轉錄，實際上其與組蛋白修飾、DNA突變、小RNA表達等都有非常復雜的相互調控作用。廣州目標位點甲基化重測序怎么解決

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