DNA甲基化是指在DNA甲基轉移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子發生甲基化的生物化學過程。DNA胞嘧啶甲基化是一種穩定的表觀遺傳學標記，在調控特定基因表達、轉座子沉默、基因印記、X染色體失活以及基因組穩定性等多種生物學過程中發揮著重要作用。在動物中，DNA甲基化主要發生在CpG二核苷酸的背景下，約為70-80%的DNA甲基化。然而，剩余未發生甲基化的CpG位點則主要密集分布于基因的啟動子區域和the first exon region，被稱為CpG島(CpG island)，在基因表達的調控和基因突變上都可能發揮著重要作用。DNA甲基化屬于表觀遺傳的范疇。成都亞硫酸鹽甲基化重測序
5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型，能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法，能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水平，快速準確鑒定出差異甲基化區域，有助于我們更加***深入地了解動、植物的甲基化模式和表觀調控機制，在動物行為、植物脅迫、植物性狀、胚胎發育、cancer疾病、生物標記物等方面具有普遍的應用。浙江目標區域甲基化重測序哪個公司做DNA甲基化是DNA化學修飾的一種形式，能夠在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表現。
全基因組甲基化測序結合了亞硫酸氫鹽轉化（bisulfiteconversion）方法與新一代高通量測序技術，可在單堿基分辨率水平上高效地檢測全基因組DNA甲基化狀態。亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，PCR擴增所需片段，則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。對PCR產物進行高通量測序，與參考序列比對，即可判斷CpG/CHG/CHH位點是否發生甲基化。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位，上海市****，至今已有16年的歷史。
物種的DNA甲基化率通常與物種基因組大小成正比。從細菌的數千個基因進化到高等動物的數萬個基因，基因數增長的一個數量級。要管好這么多的基因，在漫長的一生中有規律地關閉或打開基因表達，DNA甲基化這個開關對高等動植物必不可少。轉座子是一類在基因組上可以自主復制（或剪切）和移動的**功能元件。如果它們隨意移動，對基因組的穩定性具有破壞作用。DNA甲基化對轉座子的移動具有抑制作用。通常，物種的基因組越大，其基因組中轉座子的比例越高，那么限制轉座子移動的門神——DNA甲基化的比例就越高。重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序（NGS）的結合。
DNA甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5-mC）和少量的N6-甲基嘌呤（N6-mA）及7－甲基鳥嘌呤（7-mG）結構基因含有很多CpG 結構, 2CpG 和2GPC 中兩個胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且兩個甲基集團在DNA 雙鏈大溝中呈特定三維結構。基因組中60%～ 90% 的CpG 都被甲基化, 未甲基化的CpG 成簇地組成CpG 島,位于結構基因啟動子的core序列和轉錄起始點。有實驗證明超甲基化阻遏轉錄的進行。DNA 甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化, 使DNA 失去核酶?限制性內切酶的切割位點, 以及DNA 酶的敏感位點, 使染色質高度螺旋化, 凝縮成團, 失去轉錄活性。5 位C 甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能導致基因置換突變, 發生堿基錯配: T2G, 如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或cancer, 而且, 生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。常規全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶，在超聲波打斷基因組DNA*段的兩端連接接頭序列。河南目標位點甲基化重測序機構
亞硫酸氫鹽處理是一種分類5-甲基胞嘧啶和非甲基化堿基的有效方法之一。成都亞硫酸鹽甲基化重測序
Hi-Methylseq結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術，可實現多區段、多位點的甲基化精確定量分析，適用于感興趣的目的片段的甲基化研究和在大樣本中進一步確認全基因組甲基化研究挑選的陽性位點。采用翼和自主知識產權的多重PCR捕獲技術，確保目的片段有效富集，經亞硫酸氫鹽處理后，DNA序列復雜度嚴重降低，嚴格控制建庫PCR的循環數，降低非特異性擴增，通過將參考序列中的C堿基全部替換為T堿基，然后將測序reads比對到轉換后的參考序列上，針對每一個CpG位點，統計C和T堿基的讀數（類似于SNP calling），來判斷該位點的甲基化。成都亞硫酸鹽甲基化重測序
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