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山東STR/SSR基因SNP分型送樣要求

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-25

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增,不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分。混合樣本后,在IonProton/IonTorrent平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,,終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定,相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù),基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供snp分型服務(wù)。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性。山東STR/SSR基因SNP分型送樣要求

片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法——RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism)法的基本原理是通過(guò)PCR擴(kuò)增目的片段DNA,擴(kuò)增產(chǎn)物再用特異性內(nèi)切酶酶切成不同大小的片段,直接通過(guò)凝膠電泳分辨基因型。不同等位基因的限制性酶切位點(diǎn)分布不同,產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的DN*段條帶。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào):上海翼和生物STR基因SNP分型外包服務(wù)多態(tài)性是一個(gè)群體概念,多態(tài)性指這個(gè)差異占群體的1%以上。否則就叫突變(小于1%)。

相信大家都聽過(guò)或已經(jīng)接觸過(guò)一些常用的分型方法,如片段長(zhǎng)度多態(tài)性(限制性內(nèi)切酶)法,直接測(cè)序法,Taqman熒光探針?lè)ǎ琇DR連接酶檢測(cè)反應(yīng)法,競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法(KASP),二代測(cè)序法等,小E就針對(duì)以上幾種常用分型方法為大家做一個(gè)介紹和總結(jié)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。

以上就是小E對(duì)幾種SNP分型技術(shù)的簡(jiǎn)單介紹,大家可以看出分型技術(shù)多種多樣,各有各的優(yōu)點(diǎn)和限制。大家需要綜合考慮實(shí)驗(yàn)的各方面情況,如實(shí)驗(yàn)規(guī)模(多少位點(diǎn),多少樣本),實(shí)驗(yàn)周期,實(shí)驗(yàn)預(yù)算等,然后選擇一個(gè)適合自己實(shí)驗(yàn)的分型技術(shù)。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。美國(guó)學(xué)者Eric S. Lander于1996年正式提出單核苷酸多態(tài)性(SNP)為第三代分子標(biāo)記.

TaqMan熒光探針?lè)▋?yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單,準(zhǔn)確性高(閉管進(jìn)行,減少污染),判讀也很方便,認(rèn)可度高;適合多樣本,少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng),價(jià)格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針?lè)ㄒ话銥橹挥袔讉€(gè)位點(diǎn)時(shí)適用,并且對(duì)樣本的質(zhì)量要求較高,除了樣本無(wú)降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,地址:上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502探針的5’-端和3’-端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。山東STR/SSR基因SNP分型送樣要求

一次研究的SNP大概有十幾個(gè)到幾十個(gè),這是比較早期的做法。山東STR/SSR基因SNP分型送樣要求

隨著二代測(cè)序技術(shù)的普及,相比Sanger測(cè)序,以降低測(cè)序讀長(zhǎng)的前提,極大增加的測(cè)序通量同時(shí)大幅降低測(cè)序成本。利用二代測(cè)序進(jìn)行SNP分型,不僅測(cè)序讀長(zhǎng)滿足分型需求,可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測(cè)序法,除了保留測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測(cè)序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無(wú)錫分公司(無(wú)錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無(wú)錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號(hào)七號(hào)樓一樓。微信公眾號(hào):上海翼和生物山東STR/SSR基因SNP分型送樣要求

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