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浙江小鼠STR鑒定分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-27

小師弟:如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系的身份?收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及STR信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。如果細(xì)胞樣本的每個(gè)STR位點(diǎn)和參考細(xì)胞STR位點(diǎn)都能重合匹配,即說(shuō)明該細(xì)胞系正確,反之則說(shuō)明你的細(xì)胞系可能被錯(cuò)誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說(shuō)來(lái),匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說(shuō)明該細(xì)胞系的來(lái)源需要被懷疑。如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯(cuò)誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問(wèn)題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購(gòu)買一株新的細(xì)胞系。翼和生物人源細(xì)胞鑒定包含哪些結(jié)果?浙江小鼠STR鑒定分析

上海翼和公司為客戶提供基于qPCR技術(shù)的種系鑒定方案,選擇人、小鼠、大鼠和倉(cāng)鼠基因組中特異基因片段,設(shè)計(jì)引物和熒光探針,快速鑒定種系來(lái)源。該方案靈敏度和特異性高,可以檢測(cè)樣本中不同種系來(lái)源的細(xì)胞污染,當(dāng)污染細(xì)胞占比> 5% 時(shí),可被穩(wěn)定檢出。在PCR反應(yīng)中,除了正向引物和反向引物外,還引入了第三個(gè)寡核苷酸序列,這是一個(gè)重大的進(jìn)展。這個(gè)額外的序列,就是探針(Probe),它彌補(bǔ)了DNA結(jié)合染料的缺點(diǎn)。探針上有熒光修飾基團(tuán),可產(chǎn)生熒光信號(hào)。江蘇細(xì)胞鑒定標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系用錯(cuò)的概率有多大?

值得注意的是,當(dāng)發(fā)生兩個(gè)或以上細(xì)胞混合的時(shí)候,檢測(cè)結(jié)果看起來(lái)非常像細(xì)胞系的“遺傳不穩(wěn)定”——當(dāng)一個(gè)細(xì)胞系存在亞群時(shí),尤其是一些*細(xì)胞系,由于遺傳不穩(wěn)定的存在,在一些位點(diǎn)的STR特性會(huì)不同。因此經(jīng)驗(yàn)豐富的分子**是非常重要的,他能夠幫助分析復(fù)雜的電泳圖譜(STR峰圖),從而判斷是否由于發(fā)生細(xì)胞系交叉污染而導(dǎo)致多等位基因情況。上海翼和應(yīng)用生物,作為老牌的遺傳技術(shù)服務(wù)公司,十年以上基因分型經(jīng)驗(yàn),可以幫你解決你的疑惑。

翼和送樣要求有以下幾點(diǎn): 1.細(xì)胞上清:在無(wú)抗生su及其它抑菌或滅菌物質(zhì)條件下培養(yǎng)3天,取1.0ml 細(xì)胞培養(yǎng)上清液移至2ml離心管中,請(qǐng)加冰袋運(yùn)輸。2.細(xì)胞沉淀:在無(wú)抗生su及其它抑菌或滅菌物質(zhì)條件下培養(yǎng)3天,取1.0ml 細(xì)胞培養(yǎng)上清液移至2ml 離心管中。將上清液移入無(wú)菌離心管以15,000-20,000g 速度離心10 分鐘,移除上清液,保留離心沉淀物(若貼壁細(xì)胞,使用細(xì)胞刮刮取細(xì)胞,吸取轉(zhuǎn)移至1.5ml離心管,12000rpm離心沉淀細(xì)胞),請(qǐng)加冰袋運(yùn)輸。翼和生物細(xì)胞鑒定搭檔好禮,送!送!送!

什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定?(1)當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí)(2)一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí)(3)在細(xì)胞凍存之前,或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2~3個(gè)月時(shí)(4)發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前(5)細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)(6)當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過(guò)一種細(xì)胞系時(shí),所有細(xì)胞系比較好先鑒定以排除交叉污染的可能。如何提供鑒定樣本?每種細(xì)胞需單獨(dú)收集在1.5ml離心管中,細(xì)胞數(shù)目不少于 106個(gè)。細(xì)胞需要離心沉淀,并且以PBS清洗盡可能去除上清培養(yǎng)基,沉淀沉淀進(jìn)行冰凍保存與寄送。上海翼和生物是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位、翼和**是ATCC國(guó)際細(xì)胞系認(rèn)證委員會(huì)成員。上海細(xì)胞鑒定周期

翼和資質(zhì):上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位、國(guó)際細(xì)胞系認(rèn)證委員會(huì)成員。浙江小鼠STR鑒定分析

STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3~7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列普遍存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR已被普遍應(yīng)用于親子鑒定、個(gè)體識(shí)別、司法鑒定、交通事故鑒定、(造血干細(xì)胞)移植醫(yī)治后嵌合情況監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域。STR基因座位上的等位基因可通過(guò)PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別,隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。浙江小鼠STR鑒定分析

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