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高同源SNP分型分析

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-01

RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡(jiǎn)單,結(jié)果判斷容易,不需要昂貴的設(shè)備,成本低,并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡(jiǎn)單。但是通過(guò)SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低,很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測(cè),而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買(mǎi)到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果,且工作量大,耗時(shí)長(zhǎng),通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù),在通量和效率上難以滿(mǎn)足批量分型需求,因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司普通的二代測(cè)序SNP分型,利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs,難度比較高。高同源SNP分型分析

序列的相似性和序列的同源性有一定的關(guān)系,一般來(lái)說(shuō)序列間的相似性越高的話(huà),它們是同源序列的可能性就越高,所以經(jīng)常可以通過(guò)序列的相似性來(lái)推測(cè)序列是否同源。正因?yàn)榇嬖谶@樣的關(guān)系,很多時(shí)候?qū)π蛄械南嗨菩院屯葱跃蜎](méi)有做很明顯的區(qū)分,造成經(jīng)常等價(jià)混用兩個(gè)名詞。所以有出現(xiàn)A序列和B序列的同源性為80%一說(shuō)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,上海市****,至今已有十六年歷史,專(zhuān)注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。廣州高同源序列SNP分型技術(shù)服務(wù)翼和生物自主研發(fā)多重長(zhǎng)片段巢式PCR技術(shù),解決高同源區(qū)段SNP分型難題。

主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個(gè)相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對(duì)比,比對(duì)出其相似的程度。相似度越高,說(shuō)明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,至今已有十六年歷史,專(zhuān)注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。

SNP全稱(chēng)Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類(lèi)家族和動(dòng)植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被比較常見(jiàn)用于群體遺傳學(xué)研究和疾病相關(guān)基因的研究。上海翼和應(yīng)用生物公司開(kāi)展此業(yè)務(wù)有十余年了,技術(shù)水平過(guò)硬和售后服務(wù)周到,得到客戶(hù)的一致好評(píng),而且價(jià)格優(yōu)惠。針對(duì)已知SNP的分型,也有很多低通量的解決方案,但是高通量的解決方案還沒(méi)有很好的方法來(lái)解決。

為了獲得更多糖原相關(guān)SNP位點(diǎn),作者選擇了包括Cg_GD1基因在內(nèi)的5個(gè)基因,64個(gè)個(gè)體(32個(gè)高糖原個(gè)體和32個(gè)低糖原個(gè)體)進(jìn)行重測(cè)序,,后得到732個(gè)高質(zhì)量SNP。其中32個(gè)位于Cg_GD2基因,256個(gè)位于Cg_GS基因,用于后續(xù)的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示有兩個(gè)SNP與糖原含量有關(guān)。分別是位于Cg_GD1基因第15個(gè)內(nèi)含子的SNP(Cg_SNP_3021(R(A/G))),和位于Cg_GD1基因的SNP(Cg_SNP_3021)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史。多重長(zhǎng)片段PCR技術(shù),結(jié)合了長(zhǎng)片段PCR和多重PCR的優(yōu)勢(shì),是解決多個(gè)高同源區(qū)段SNP分型分析的有效手段。高同源區(qū)段分型準(zhǔn)確度高

可以根據(jù)以往文獻(xiàn),在所研究疾病的多個(gè)候選基因上面選擇多個(gè)SNP,比如選擇DNA修復(fù)通路中幾個(gè)基因的重要SNP.高同源SNP分型分析

TaqMan熒光探針?lè)▋?yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單,準(zhǔn)確性高(閉管進(jìn)行,減少污染),判讀也很方便,認(rèn)可度高;適合多樣本,少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性,如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng),價(jià)格昂貴,為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量,一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針?lè)ㄒ话銥橹挥袔讉€(gè)位點(diǎn)時(shí)適用,并且對(duì)樣本的質(zhì)量要求較高,除了樣本無(wú)降解外,要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司,地址:上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502高同源SNP分型分析

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司。公司業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù)等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),還有一批**的專(zhuān)業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。翼和生物秉承“客戶(hù)為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營(yíng)理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。

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