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南京細胞鑒定數據庫比對

來源: 發布時間:2021-11-01

短串聯重復(Short tandem repeats, STR),又稱微衛星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯配引起的復制滑動被認為是導致STR產生的較為常見原因,并且依據不同復制單元大小的不同以及不同物種之間,復制滑動發生的概率也不相同。STR已被廣泛應用于親子鑒定、個體識別、司法鑒定、交通事故鑒定、(造血干細胞)移植醫治后嵌合情況監測等領域。上海翼和生物業務領域涵蓋多重PCR靶向捕獲二代測序、STR遺傳背景鑒定和SNP基因分型三大板塊。南京細胞鑒定數據庫比對

為什么要做支原體污染檢測?在細胞研究領域,支原體是臭名昭著的污染源,許多實驗室都深受其害。支原體傳染能在不知不覺中干擾研究結果,浪費大量的資金投入。研究表明,95%以上污染細胞的支原體屬于以下四種類型:口腔支原體(M.orale)、精氨酸支原體(M.arginini)、豬鼻支原體(M.hyorhinis)和萊氏無膽甾原體(A.laidlawii,此種支原體為牛源性)。這是四種比較常見的污染細胞的支原體菌群,但實際中能夠污染細胞的支原體的種類是很多的。國外的調查證明,有二十多種支原體可以污染細胞,并且有的細胞可以同時被兩種以上的支原體污染。廣州細胞鑒定周期細胞STR鑒定助力論文發表Cancer Research。

上海翼和公司利用熒光PCR擴增小鼠基因組中9個STR基因位點,PCR產物在毛細管電泳分離之后可通過熒光檢測進行基因分型。根據所得的STR分型結果與細胞STR數據庫(EXPASY)比對,從而鑒定樣品所屬的小鼠細胞系。2017年4月,翼和客戶山東泰山醫學院免疫所發表了EBioMedicine上的一篇論文,該文中編輯要求對突變小鼠的遺傳背景進行鑒定,翼和公司應用基于多重PCR與二代測序的近交系小鼠檢測方案2.0版本方案,成功的對基因編輯小鼠進行了測試,并對小鼠遺傳背景進行了STR鑒定,雜志編輯成功接受。

在過去的的幾十年間,在細胞生物學領域,文章一直在發表,科研成果一直在公布,但是當中哺乳動物細胞被錯誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時存在著。2010年有雜志(IJC)統計出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細胞被Hela細胞污染的情況。當然還有,在2001年,科學家在一篇論文里報道了一株新建立的大鼠(rat)視網膜神經節的細胞系(留個印象是大鼠來源的),命名為RGC-5。在隨后的十幾年時間里,至少230篇論文的研究與假設是建立在這株細胞系上。結果在2009年,序列測定結果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)細胞。隨著越來也多細胞被污染的問題出現,大家也開始意識到細胞污染的嚴重性,2007年,NIH強烈建議在使用細胞時進行鑒定。目前STR基因分型方法被認為是檢測細胞交叉污染和性質鑒定極為有效以及準確的方法,多個細胞庫分別提供了各種細胞株的STR基因分析數據以供參考比對。常見的細胞系除了發現種屬內的交叉污染/錯誤鑒定,還有部分細胞系被發現連種屬都被錯誤鑒定了!

有名的Hela細胞,源自一名美國黑人婦女的子宮頸細胞。這位理應在生物學史上占據一定地位的女性,名叫Henrietta Lacks,死于子宮頸*。自1951年至今,Hela細胞已被培養了60多年,分裂了近2萬次,仍然無停止跡象,是為不死的傳說,參見一本書《永生的海拉》。Hela為什么可以永生,據說其基因組插入了人類HPV18,成了HPV細胞,這些可惡的HPV細胞不僅在我們人體里不停的分裂繁殖,直到我們逝去,在分離細胞系里仍可以不斷的分裂,一般細胞分裂后端粒會老化變短,直至細胞系終結。Hella細胞似乎在每次分裂時,端粒酶活性很高,可以復制出新的端粒,以維持端粒長度,避開所謂的“海佛烈克極限”(Hayflick limit)(正常的細胞系,分裂極限在52次左右)。本文使用的Hela**細胞,由上海翼和應用生物技術有限公司鑒定。成都STR鑒定數據庫

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什么是細胞系鑒定?所謂細胞系鑒定即通過STR(短串聯重復)圖譜所建立細胞系的遺傳特征。一株細胞系的遺傳特征確立后,細胞系可以通過定期的檢測,以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。為什么要進行細胞系鑒定?由于細胞系發生交叉污染或身份誤認,將導致實驗數據的無效或數據誤導。NIH已發出公告,討論細胞系鑒定的必要性與重要性,并且越來越多的的期刊要求文章發表前、需提供細胞鑒定數據。細胞系用錯的概率有多大?據ATCC估計,1977年錯誤使用細胞的概率是16%,1999年是18%。根據我們的經驗,國內細胞系用錯的概率不低于20%。即如果一個研究所有二十個課題組,按概率估計,有4個課題組用的細胞是錯的。南京細胞鑒定數據庫比對

上海翼和應用生物技術有限公司專注技術創新和產品研發,發展規模團隊不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創新精神的團隊。公司業務范圍主要包括:細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。公司深耕細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展。

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