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廣州基因SNP分型準(zhǔn)確度高

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-03

將待檢測(cè)片段(包含待測(cè)SNP位點(diǎn))進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接進(jìn)行測(cè)序是SNP檢測(cè)方法中,準(zhǔn)確的一種,堪稱(chēng)SNP分型的“金標(biāo)準(zhǔn)”。獲得測(cè)序峰圖,純和位點(diǎn)為單峰,而雜合位點(diǎn)則為套峰,因此通過(guò)查看測(cè)序峰圖很容易將基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè),還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。直接測(cè)序法的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)果準(zhǔn)確,能發(fā)現(xiàn)未知位點(diǎn),但是其缺點(diǎn)是通量低,成本高。因此直接測(cè)序法適用于少位點(diǎn),少樣本的分型規(guī)模,當(dāng)然土豪實(shí)驗(yàn)室除外!所以這種方法也很難在商業(yè)化大規(guī)模的分型實(shí)驗(yàn)中得到推廣。對(duì)于SNP 研究,我個(gè)人的感覺(jué)是:曾經(jīng)非常的“熱”過(guò),而現(xiàn)在,似乎有些降溫。廣州基因SNP分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是一具有16年行業(yè)經(jīng)驗(yàn)的專(zhuān)業(yè)遺傳學(xué)服務(wù)供應(yīng)商。公司的首席科學(xué)家為肖君華教授(東華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)研究所教授;中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)理事;上海市遺傳學(xué)會(huì)常務(wù)理事)。公司擁有兩大專(zhuān)業(yè)平臺(tái):基于一代測(cè)序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺(tái);基于多重PCR捕獲建庫(kù)技術(shù)的二代測(cè)序平臺(tái)。為順應(yīng)市場(chǎng)需求,公司在2019年開(kāi)拓了個(gè)人基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。目前已開(kāi)展心血管個(gè)體化用藥相關(guān)基因的檢測(cè),孕婦葉酸及鈣代謝兩項(xiàng)基因檢測(cè)業(yè)務(wù)。兩項(xiàng)基因檢測(cè)均基于翼和一代測(cè)序平臺(tái)的PCR-LDRSNP基因分型方法。北京微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型外包服務(wù)通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。

3、SNP等位基因頻率的容易估計(jì)。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是:首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后將待測(cè)的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比較,根據(jù)所得信號(hào)的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性,也有利于對(duì)其進(jìn)行基因分型。對(duì)SNP進(jìn)行基因分型包括三方面的內(nèi)容:(1)鑒別基因型所采用的化學(xué)反應(yīng),常用的技術(shù)手段包括:DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應(yīng)、側(cè)翼探針切割反應(yīng)以及基于這些方法的變通技術(shù);(2)完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進(jìn)行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。(3)化學(xué)反應(yīng)結(jié)束后,需要應(yīng)用生物技術(shù)系統(tǒng)檢測(cè)反應(yīng)結(jié)果。

高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡(jiǎn)稱(chēng)HRM)分析是一門(mén)新興的技術(shù)。它通過(guò)PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測(cè)PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡(jiǎn)便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時(shí)是通過(guò)紫外吸收來(lái)監(jiān)測(cè)的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個(gè)小時(shí)才能完成。后來(lái),LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級(jí),且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時(shí)間縮短至幾分鐘。當(dāng)時(shí)使用的染料是SYBR?GreenI。完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進(jìn)行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。

為了評(píng)估在這些前體miRNA中的5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與中國(guó)漢族人群個(gè)體中潛在的關(guān)聯(lián),作者采用了PCR-LDR的方法在287例心肌梗死病人和646個(gè)對(duì)照組樣本中檢測(cè)5個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的SNP分型。并用SPSS軟件分析了SNP位點(diǎn)與MI風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。(其中,PCR-LDR法SNP分型在上海翼和生物有限公司完成)。上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專(zhuān)業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價(jià)比高、可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。現(xiàn)在國(guó)外的趨勢(shì)更傾向于,對(duì)于某一疾病的重要候選基因.無(wú)錫微衛(wèi)星標(biāo)記strSNP分型公司

這種選擇具有準(zhǔn)確性高的特點(diǎn),能夠有效避免形態(tài)學(xué)和環(huán)境因素的干擾,從而極大的縮短育種進(jìn)程。廣州基因SNP分型準(zhǔn)確度高

理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性,但實(shí)際上,后兩者非常少見(jiàn),幾乎可以忽略。因此,通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(CT,在其互補(bǔ)鏈上則為GA),也可能是顛換(CA,GT,CG,AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3,其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點(diǎn)。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高,可能是因?yàn)镃pG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類(lèi)基因組中,易發(fā)生突變的位點(diǎn),其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來(lái)說(shuō),位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP(codingSNP,cSNP)比較少,因?yàn)樵谕怙@子內(nèi),其變異率及周?chē)蛄械?/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義,因此cSNP的研究更受關(guān)注。廣州基因SNP分型準(zhǔn)確度高

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司主營(yíng)品牌有Biowing,發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大,該公司服務(wù)型的公司。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù),是一家私營(yíng)有限責(zé)任公司企業(yè)。公司業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測(cè),生物技術(shù)服務(wù),價(jià)格合理,品質(zhì)有保證,深受廣大客戶的歡迎。翼和生物將以真誠(chéng)的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品,為彼此贏得全新的未來(lái)!

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