亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進行化學處理會使甲基化特異性序列變異，從而可以通過NGS進行定位和量化，主要的DNA甲基化數據分析流程：獲得DNA甲基化數據之后，首先，需要對數據進行處理和質量的基本控制，包括原始測序和芯片數據的讀取、轉換到產生準確的DNA甲基化圖譜；其次，需要對DNA甲基化位點的結果進行可視化，并且利用統計學方法鑒定樣本特異性差異的DNA甲基化位點；第三，驗證 DNA 甲基化差異位點，并且對其進行生物學解釋。DNA甲基化主要發生在啟動子區CPG島,在調節基因表達和其他功能方面起著關鍵作用.杭州目標區段甲基化重測序哪里做

全基因組重亞硫酸鹽甲基化測序（WGBS）可以在全基因組范圍內精確的檢測所有單個胞嘧啶堿基（C堿基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金標準。WGBS能為基因組DNA甲基化修飾的研究提供重要技術支持，能廣泛應用在個體發育、衰老和cancer發生等生命過程的機制研究中。其原理是用 Bisulfite 處理DNA序列，首先將基因組中未發生甲基化的 C 堿基轉換成U（T），從而與原本具有甲基化修飾的堿基C區分開來，然后進行PCR擴增，結合高通量測序技術，適用于全基因組范圍內繪制單堿基分辨率的DNA 甲基化圖譜。河南目標甲基化重測序哪里做WGBS全稱全基因組重亞硫酸鹽測序，該方法通過Bisulfite處理。

5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC) 是一種常見的DNA修飾類型，能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法，能夠實現單堿基分辨率的甲基化位點準確、高效定位。通過***分析不同處理方式下的全基因組甲基化水平，快速準確鑒定出差異甲基化區域，有助于我們更加***深入地了解動、植物的甲基化模式和表觀調控機制，在動物行為、植物脅迫、植物性狀、胚胎發育、cancer疾病、生物標記物等方面具有普遍的應用。

DNA甲基化過程在一些生物學現象中起重要作用。例如，在原核生物中，它參與毒力、細胞周期調控、基因表達和對外源 DNA 導入的保護（DNA-宿主特異性）等過程。在高等真核生物中，DNA 甲基化參與調控染色體穩定性、印記、X 染色體失活和cancer 變等多個細胞過程。在哺乳動物中，DNA 甲基化主要發生在胞嘧啶堿基的第五個碳原子上，形成 5-甲基胞嘧啶或 5-甲基胞嘧啶核苷 (5-mC)。DNA甲基化幾乎只存在于CpG二核苷酸上，是一個關鍵的表觀遺傳標記和基因表達調控因子。基因啟動子或 CpG 島處的甲基化 CpG 簇與基因失活有關。DNA 甲基化由一個被稱為 DNA 甲基轉移酶并包括 DNMT1、DNMT3a 和 DNMT3b 的酶家族催化。DNMT3a 和 DNMT3b是從頭合成的甲基轉移酶，能夠甲基化之前未甲基化的 CpG二核苷酸。相反，DNMT1是一種維持性甲基轉移酶，在復制過程中修飾半甲基化的 DNA。亞硫酸氫鹽處理是一種分類5-甲基胞嘧啶和非甲基化堿基的有效方法之一。

亞硫酸氫鈉轉化是分析胞嘧啶甲基化效果比較好的工具之一。該方法基于亞硫酸氫鈉對 DNA 的處理，確定其甲基化模式。重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序（NGS）的結合。甲基化的金標準是亞硫酸氫鹽測序法：用亞硫酸氫鹽處理DNA，未發生甲基化的胞嘧啶能夠被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶則保持不變，通過后續的測序即可檢測。利用亞硫酸氫鹽的這種原理，可以衍生出多種甲基化檢測方法，如甲基化特異性的PCR和高分辨率熔解曲線法。常規全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶，在超聲波打斷基因組DNA段的兩端連接接頭序列。河南目標甲基化重測序哪里做

在前期全基因組甲基化測序等工作基礎上，利用Hi-MethylSeq技術對大規模群體的候選基因甲基化水平進行檢測。杭州目標區段甲基化重測序哪里做

在表觀遺傳中，DNA甲基化修飾具有非常重要的地位。其中胞嘧啶雜環5號位的甲基化修飾，又稱作5-甲基胞嘧啶（5mC），是**常見的甲基化修飾方式，也是迄今為止研究**為普遍的DNA甲基化修飾方式。一般認為當DNA甲基化出現在基因啟動子區，就會抑制基因轉錄，從而起到負調控的作用。DNA甲基化的形成機制，包括從頭合成（de novo），甲基化的維持（Maintenance）和去甲基化（Demethylation），這些過程分別由不同的基因和通路調控。這些基因和通路在動植物中即保守，又有所區別。杭州目標區段甲基化重測序哪里做

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