亞硫酸氫鈉轉化是分析胞嘧啶甲基化效果比較好的工具之一。該方法基于亞硫酸氫鈉對 DNA 的處理，確定其甲基化模式。重亞硫酸鹽測序本質上就是重亞硫酸鹽轉化與二代測序（NGS）的結合。甲基化的金標準是亞硫酸氫鹽測序法：用亞硫酸氫鹽處理DNA，未發生甲基化的胞嘧啶能夠被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶則保持不變，通過后續的測序即可檢測。利用亞硫酸氫鹽的這種原理，可以衍生出多種甲基化檢測方法，如甲基化特異性的PCR和高分辨率熔解曲線法。DNA復制后胞嘧啶的甲基化會改變DNA的構象，使DNA的大溝無法與DNA結合蛋白正常結合。蘇州目標區域甲基化重測序公司

DNA甲基化是表觀遺傳調控的常見機制。啟動子區域的高度甲基化可導致基因表達改變。甲基化多發生于胞嘧啶（cytosine, C）位置。在細胞和組織分化、疾病發生以及適應環境等過程中，甲基化狀態可發生改變。高精確度全基因組甲基化修飾狀態的分析，將為發育、育種、tumour標志物鑒定或藥物靶標尋找等研究奠定基礎。全基因組甲基化測序結合了亞硫酸氫鹽轉化（bisulfite conversion）方法與新一代高通量測序技術，可在單堿基分辨率水平上高效地檢測全基因組DNA甲基化狀態。亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，PCR擴增所需片段，則尿嘧啶全部轉化成胸腺嘧啶。對PCR產物進行高通量測序，與參考序列比對，即可判斷CpG/CHG/CHH位點是否發生甲基化。杭州目標區域甲基化重測序公司上海翼和生物甲基化測序采用的是重亞硫酸鹽擴增子測序法，重亞硫酸鹽轉化是研究DNA甲基化的金標方法。

Hi-Methylseq結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術，可實現多區段、多位點的甲基化精確定量分析，適用于感興趣的目的片段的甲基化研究和在大樣本中進一步確認全基因組甲基化研究挑選的陽性位點。采用翼和自主知識產權的多重PCR捕獲技術，確保目的片段有效富集，經亞硫酸氫鹽處理后，DNA序列復雜度嚴重降低，嚴格控制建庫PCR的循環數，降低非特異性擴增，通過將參考序列中的C堿基全部替換為T堿基，然后將測序reads比對到轉換后的參考序列上，針對每一個CpG位點，統計C和T堿基的讀數（類似于SNP calling），來判斷該位點的甲基化。

DNA甲基化屬于表觀遺傳的范疇。表觀遺傳屬于一種可以對環境產生應答和改變的遺傳機制。機體細胞在經歷脅迫、創傷等環境變化后，會產生特定的應答，并往往會用DNA甲基化、組蛋白修飾等形式將應激的模式記錄在DNA修飾中。這種脅迫記憶可以幫助細胞在面臨下一次應激的時候快速適應。同時，這種表觀修飾可以通過遺傳的方式傳遞給下一代細胞。對于高等動植物，通常壽命都比較漫長。在漫長的一生中，一方面機體會經歷大量的環境應答，另一方面細胞將會分裂多代。那么機體就更需要將應答的信息，存儲在DNA甲基化中傳遞給后代的細胞，以提高這個物種的環境適應能力。Hi-Methylseq結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術，可實現 多區段、多位點的甲基化精確定量分析。

DNA甲基化可以抑制基因表達。其機制是當DNA甲基化出現在啟動子區，其會強化啟動子序列的異染色質化（染色體擰巴在一起），而使轉錄起始復合物無法接近和結合，從而強化基因的轉錄抑制。只有保持開放性常染色質狀態的轉錄起始位點，才能保證轉錄起始蛋白復合物可接近并結合這個區域，從而保證基因的轉錄表達。當DNA甲基化出現在編碼基因不同區域的時候（上游，基因區或下游），其對基因表達的影響也是不同的。同時，DNA甲基化不僅只影響基因轉錄，實際上其與組蛋白修飾、DNA突變、小RNA表達等都有非常復雜的相互調控作用。表觀遺傳學研究已經證實了特定基因區域的DNA甲基化修飾對于染色體構象、基因表達調控機制有著重要影響。蘇州目標位點甲基化重測序報告

全基因組甲基化測序:利用Bisulfite(亞硫酸鹽)對基因組進行處理后上機測序。蘇州目標區域甲基化重測序公司

DNA甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5-mC）和少量的N6-甲基嘌呤（N6-mA）及7－甲基鳥嘌呤（7-mG）。結構基因含有很多CPG結構, 2CPG 和2GPC 中兩個胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且兩個甲基集團在DNA 雙鏈大溝中呈特定三維結構。基因組中60%～ 90% 的CPG 都被甲基化, 未甲基化的CPG 成簇地組成CPG 島,位于結構基因啟動子的core序列和轉錄起始點。有實驗證明超甲基化阻遏轉錄的進行。DNA 甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化, 使DNA 失去核酶ö限制性內切酶的切割位點, 以及DNA 酶的敏感位點, 使染色質高度螺旋化, 凝縮成團, 失去轉錄活性。5 位C 甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能導致基因置換突變, 發生堿基錯配: T2G, 如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或cancer, 而且, 生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。蘇州目標區域甲基化重測序公司

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