SNP全稱SingleNucleotidePolymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能,從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類家族和動(dòng)植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被比較常見用于群體遺傳學(xué)研究和疾病相關(guān)基因的研究。上海翼和應(yīng)用生物公司開展此業(yè)務(wù)有十余年了,技術(shù)水平過硬和售后服務(wù)周到,得到客戶的一致好評(píng),而且價(jià)格優(yōu)惠。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性。上海SSR基因SNP分型周期
高分辨率熔解(High-resolutionmelting,簡稱HRM)分析是一門新興的技術(shù)。它通過PCR之后的熔解曲線分析,就能檢測PCR片段的微小序列差異,從而應(yīng)用在突變掃描、序列配對(duì)和基因分型等多個(gè)方面。憑借其速度和簡便性,高分辨率熔解這種方法正在迅速普及。其實(shí)雙鏈DNA的熔解分析可追溯到上世紀(jì)六十年代,當(dāng)時(shí)是通過紫外吸收來監(jiān)測的。分析需要幾微克的DNA,而樣品以0.1-1.0°C/分鐘的速率緩慢加熱,常常要花上幾個(gè)小時(shí)才能完成。后來,LightCycler定量PCR儀的出現(xiàn),讓熒光熔解分析變得流行。樣品量因毛細(xì)管而縮減至納克級(jí),且熔解速率更快,達(dá)0.1-1.0°C/秒,這樣熔解時(shí)間縮短至幾分鐘。當(dāng)時(shí)使用的染料是SYBR?GreenI。江蘇微衛(wèi)星標(biāo)記SNP分型分析組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成。
隨著二代測序技術(shù)的普及,相比Sanger測序,以降低測序讀長的前提,極大增加的測序通量同時(shí)大幅降低測序成本。利用二代測序進(jìn)行SNP分型,不僅測序讀長滿足分型需求,可以同時(shí)對(duì)數(shù)十?dāng)?shù)百個(gè)位點(diǎn),上千樣本進(jìn)行分型。該方法相比直接測序法,除了保留測序法的優(yōu)點(diǎn)外,彌補(bǔ)了其通量不足的限制,二代測序分型法也正在快速在領(lǐng)域內(nèi)推廣。無錫分公司(無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司)地址:無錫市濱湖區(qū)梅梁西路138號(hào)七號(hào)樓一樓。微信公眾號(hào):上海翼和生物
SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,主要特點(diǎn)是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實(shí)現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時(shí)納秒(10-9s)強(qiáng)激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場中離子飛行時(shí)間與離子質(zhì)量成反比,通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時(shí)間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測出SNP位點(diǎn)信息。多態(tài)性是一個(gè)群體概念,多態(tài)性指這個(gè)差異占群體的1%以上。否則就叫突變(小于1%)。
3、SNP等位基因頻率的容易估計(jì)。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是:首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,然后將待測的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比較,根據(jù)所得信號(hào)的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性,也有利于對(duì)其進(jìn)行基因分型。對(duì)SNP進(jìn)行基因分型包括三方面的內(nèi)容:(1)鑒別基因型所采用的化學(xué)反應(yīng),常用的技術(shù)手段包括:DNA分子雜交、引物延伸、等位基因特異的寡核苷酸連接反應(yīng)、側(cè)翼探針切割反應(yīng)以及基于這些方法的變通技術(shù);(2)完成這些化學(xué)反應(yīng)所采用的模式,包括液相反應(yīng)、固相支持物上進(jìn)行的反應(yīng)以及二者皆有的反應(yīng)。(3)化學(xué)反應(yīng)結(jié)束后,需要應(yīng)用生物技術(shù)系統(tǒng)檢測反應(yīng)結(jié)果。SNP已經(jīng)廣泛應(yīng)用于人類致病基因篩選、致病風(fēng)險(xiǎn)診斷及預(yù)測、個(gè)體化藥物篩選等生物、醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域。廣東基因SNP分型
SNP本身是針對(duì)“群體”而言的(within a population)。上海SSR基因SNP分型周期
理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性,但實(shí)際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。因此,通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(CT,在其互補(bǔ)鏈上則為GA),也可能是顛換(CA,GT,CG,AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3,其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點(diǎn)。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高,可能是因?yàn)镃pG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中,易發(fā)生突變的位點(diǎn),其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說,位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP(codingSNP,cSNP)比較少,因?yàn)樵谕怙@子內(nèi),其變異率及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義,因此cSNP的研究更受關(guān)注。上海SSR基因SNP分型周期
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司擁有第三方檢測服務(wù);生物專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù);健康衰老評(píng)估;大健康檢測;遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù);生物醫(yī)藥行業(yè)質(zhì)控檢測技術(shù)技術(shù)服務(wù);小鼠遺傳品系鑒定;轉(zhuǎn)基因小鼠基因型鑒定;細(xì)胞點(diǎn)突變檢測;細(xì)胞端粒長度和端粒酶活性檢測。等多項(xiàng)業(yè)務(wù),主營業(yè)務(wù)涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。公司以誠信為本,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),我們本著對(duì)客戶負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司深耕細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù),正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。