隨著二代測序技術的普及，相比Sanger測序，以降低測序讀長的前提，**增加的測序通量同時大幅降低測序成本。利用二代測序進行SNP分型，不僅測序讀長滿足分型需求，可以同時對數十數百個位點，上千樣本進行分型。該方法相比直接測序法，除了保留測序法的優點外，彌補了其通量不足的限制，二代測序分型法也正在快速在領域內推廣。上海翼和生物提供高同源SNP分型服務，無錫分公司（無錫翼和應用生物技術有限公司）地址:無錫市濱湖區梅梁西路138號七號樓一樓。只要這個突變群沒有達到總群體的1%，它就只是一個突變株/系。達到了1%就是多態性了。高同源區段分型機構

多序列比對的意義：用于描述一組序列之間的相似性關系，以便了解一個基因家族的基本特征，尋找motif，保守區域等。用于描述一個同源基因之間的親緣關系的遠景，應用到分子進化分析中。多序列比對的方法：同源性分析中常常要通過多序列比對來找出序列之間的相互關系，和blast的局部匹配搜索不同，多序列比對大多都是采用全局比對的算法。這樣對于采用計算機程序的自動多序列比對是一個非常復雜且耗時的過程，特別是序列數目多，且序列唱的情況下。江蘇高同源區段分型送樣要求現階段，異源多倍體物種的全基因組重測序已經可以通過各式各樣的生信算法，SNP的質量也越來越好了。

SNP基因分型技術原理是PCR擴增含有SNP的基因組片段，主要特點是準確性高、靈活性強、通量大，主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴增含有SNP的基因組片段，然后通過序列特異性引物實現單堿基延伸，隨后樣品分析物與芯片基質共結晶后在真空管中受瞬時納秒 (10-9s) 強激光激發。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子，由于電場中離子飛行時間與離子質量成反比，通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時間而獲得樣品分析物的精確分子量，從而檢測出SNP位點信息。

上海翼和生物基于自主知識產權的多重PCR捕獲技術，結合特色的生信分析方法，開發了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型，**提高了SNP分型的準確度。二代測序得到單分子序列信息，通過特色生信分析方法，對混合結果進行有效拆分，準確地將測序reads比對到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對多倍體物種進行SNP精細分型。應用方向農口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發現優良等位變異；開發功能標記；定制育種Panel；分子標記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評價；群體遺傳結構分析。理論上講，SNP既可能是二等位多態性，也可能是3個或4個等位多態性。

1. SNP數量多，分布比較常見。據估計，人類基因組中每1000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基***有300萬以上的SNPs.SNP 遍布于整個人類基因組中，根據SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類。2、 SNP適于快速、規模化篩查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態的標記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長度，這就利于發展自動化技術篩選或檢測SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標準曲線，然后將待測的混和樣本與標準曲線進行比較，根據所得信號的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態性，也有利于對其進行基因分型。在進行基因組研究中經常會遇到各類高同源區段，比如人基因組中P450基因家族，HLA基因座位。廣州SNP基因分型技術服務

多重PCR是降低長片段PCR擴增成本的有效方式。高同源區段分型機構

旁系同源基因（paralogousgene）又譯為“橫向同源基因”、“并系同源基因”或“平行進化同源基因”，是指由于基因復制而產生的同源基因，例如人γ一珠蛋白基因和β一珠蛋白基因。基因復制后，進化選擇壓力變小，其中一條基因丟失或發生沉默，都能促使旁系同源基因分化，產生新特性或新功能的原因。然而，雖然某些旁系同源基因轉錄區序列相似度不高，但它們的操縱子卻仍然具有較高的保守度。值得注意的是，旁系同源基因并不局限于同一物種內，不同物種中由于始祖基因的復制而分化的基因也稱旁系同源基因，如鼠α一珠蛋白和雞β一珠蛋白基因。隨著時間的推移，它們在序列組成和功能上可能會變得不同。高同源區段分型機構

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