短串聯重復(Short tandem repeats, STR),又稱微衛星DNA(Microsatellite DNA)或簡單重復序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),是普遍存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復序列。有絲分裂過程中DNA鏈之間的錯配引起的復制滑動被認為是導致STR產生的較為常見原因,并且依據不同復制單元大小的不同以及不同物種之間,復制滑動發生的概率也不相同。STR已被廣泛應用于親子鑒定、個體識別、司法鑒定、交通事故鑒定、(造血干細胞)移植醫治后嵌合情況監測等領域。什么是細胞系STR鑒定?北京小鼠細胞STR鑒定周期
熱烈祝賀上海翼和生物客戶第三軍醫大學新橋醫院內分泌科發表文章“NRF2 activation by antioxidant antidiabetic agents accelerates tumor metastasis ”于Science Translational Medicine雜志,影響因子16.3,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的細胞系提供了細胞STR鑒定服務。恭賀上海翼和生物客戶趙永良研究員課題組在Cancer Research雜志(IF=8.5)發表研究論文。熱烈祝賀上海翼和生物客戶中科院北京基因組研究所趙永良研究員課題組默董亮博士發表文章“Human helicase RECQL4 drives cisplatin resistance in gastric cancer by activating an AKT-YB1-MDR1 signaling pathway”于Cancer Research雜志,影響因子8.556,其中上海翼和生物為研究中所涉及到的多株細胞系提供了細胞STR鑒定服務。鄭州小鼠細胞STR鑒定位點一株細胞系的遺傳特征確立后,細胞系可以通過定期的檢測,以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。
現如今,大家在購買細胞株的時候,會面臨諸多突出的問題︰①細胞活性不足,收到細胞后存活率不高,導致實驗無法正常進行;②細胞本身的質量無法保證,除正規單位的細胞外,無法確認細胞源本身質量;③市場上以次充好、良莠不齊、魚龍混珠的假細胞比比皆是、無法分辨。如果你一不注意,使用了沒有經過相應的細胞鑒定的細胞、或者是被污染的細胞,極有可能的結果就是——論文的結論被否定、論文被召回,這中間大量的時間、物力和人力均被浪費,一切都要從頭再來。
在過去的的幾十年間,在細胞生物學領域,文章一直在發表,科研成果一直在公布,但是當中哺乳動物細胞被錯誤鑒定,存在交叉污染的情況也同時存在著。2010年有雜志(IJC)統計出一列表,在346篇文章中,有 103篇存在細胞被Hela細胞污染的情況。當然還有,在2001年,科學家在一篇論文里報道了一株新建立的大鼠(rat)視網膜神經節的細胞系(留個印象是大鼠來源的),命名為RGC-5。在隨后的十幾年時間里,至少230篇論文的研究與假設是建立在這株細胞系上。結果在2009年,序列測定結果表明,RGC-5是一株小鼠(mouse)細胞。隨著越來也多細胞被污染的問題出現,大家也開始意識到細胞污染的嚴重性,2007年,NIH強烈建議在使用細胞時進行鑒定。目前STR基因分型方法被認為是檢測細胞交叉污染和性質鑒定極為有效以及準確的方法,多個細胞庫分別提供了各種細胞株的STR基因分析數據以供參考比對。所謂細胞系鑒定即通過STR(短串聯重復)圖譜所建立細胞系的遺傳特征。
如何知道細胞系是否發生交叉污染了?如果存在細胞系之間發生交叉污染,而且鑒定用的細胞可能有兩種以上的細胞系時,那么在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關系。因此,存在交叉污染的混合細胞系中,其中一個位點中某些峰會明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細胞系中那個主要細胞系,而小峰則屬于那個次要細胞系。STR鑒定目前已被ICLAC、ATCC等機構作為金標準應用于細胞鑒定,越來越多的雜志要求在投稿時提供細胞STR分型數據。存在細胞系之間發生交叉污染,在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現兩個以上的峰。浙江小鼠STR鑒定位點
細胞鑒定哪家強,上海翼和應用生物技術有限公司。本公司比較多可提供20余對STR引物,對細胞進行鑒定。北京小鼠細胞STR鑒定周期
短串聯重復序列(short tandem repeat,STR),又稱為微衛星標記(microsalite)。它普遍并均勻地存在于真核生物基因組中,一般由一個長2~6bp的中心序列經多次串聯重復排列而成,重復次數大多在10~60次之間。個體間中心序列的重復次數呈高度變異性,構成了STR的遺傳多態性。由于其序列簡短,通過PCR很容易從基因組DNA中特異性地擴增出來,極大簡化了微衛星多態性分析的操作。研究者只需在目標基因座設計一對或多對引物,通過PCR反應從模板DNA中將該基因擴增出來,然后使用測序儀進行電泳分離分析即可。它具有分布普遍,易于檢測,信息量大,有高度多態性并遵循孟德爾共顯性遺傳等優點,被認為是繼限制性片段長度多態性(RFLP)之后的第二代遺傳標記,已普遍應用于遺傳圖譜繪制、基因定位、法醫鑒定、遺傳病診斷等諸多領域。北京小鼠細胞STR鑒定周期
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