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浙江基因SNP分型分析

來源: 發布時間:2021-11-16

上海翼和應用生物技術有限公司是一具有16年行業經驗的專業遺傳學服務供應商。公司的首席科學家為肖君華教授(東華大學生物科學與技術研究所教授;中國遺傳學會理事;上海市遺傳學會常務理事)。公司擁有兩大專業平臺:基于一代測序儀3730XL的PCR-LDRSNP分型平臺;基于多重PCR捕獲建庫技術的二代測序平臺。為順應市場需求,公司在2019年開拓了個人基因檢測業務。目前已開展心血管個體化用藥相關基因的檢測,孕婦葉酸及鈣代謝兩項基因檢測業務。兩項基因檢測均基于翼和一代測序平臺的PCR-LDRSNP基因分型方法。SNP已經廣泛應用于人類致病基因篩選、致病風險診斷及預測、個體化藥物篩選等生物、醫學研究領域。浙江基因SNP分型分析

將待檢測片段(包含待測SNP位點)進行PCR擴增并直接進行測序是SNP檢測方法中,準確的一種,堪稱SNP分型的“金標準”。獲得測序峰圖,純和位點為單峰,而雜合位點則為套峰,因此通過查看測序峰圖很容易將基因型區分開來。直接測序法不僅可用于對已知位點的檢測,還可用于發現未知的SNP位點。直接測序法的優點是結果準確,能發現未知位點,但是其缺點是通量低,成本高。因此直接測序法適用于少位點,少樣本的分型規模,當然土豪實驗室除外!所以這種方法也很難在商業化大規模的分型實驗中得到推廣。廣州STRSNP分型準確度高做為一種新的遺傳標記,SNP對于疾病的預測、診斷能夠提供更加可靠的科學依據,因此對其研究具有重要意義。

單核苷酸多態性(singlenucleotidepolymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。它是人類可遺傳的變異中,常見的一種。占所有已知多態性的90%以上。SNP在人類基因組中比較常見存在,平均每500~1000個堿基對中就有1個,估計其總數可達300萬個甚至更多。SNP所表現的多態性只涉及到單個堿基的變異,這種變異可由單個堿基的轉換(transition)或顛換(transversion)所引起,也可由堿基的插入或缺失所致。但通常所說的SNP并不包括后兩種情況。

二代測序法主要通過PCR的方法,對目標SNP位點進行特異性捕獲。為了提型的通量,目前多采用多重PCR的方法同時對多個位點進行捕獲(可同時對1-100位點進行分型)。由于二代測序通量是足夠滿足數百數千樣本的同時測序,因此需要對不同的樣本添加的樣本標簽(Barcode),從而在后續數據分析過程中,能夠進行樣本拆分。因此在多重PCR完成輪多SNP位點捕獲后,需要進行第二輪PCR,在輪PCR產物的基礎上,添加樣本樣本標簽及測序接頭等序列。通過PCR條件優化,目前亦可實現一次反應,兩輪PCR接力完成的效果。對于國外SNP研究領域,我認為現在也進入了理性思考期。

連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction,LDR)是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別,高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條寡聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,連接反應就不能進行。該方法,對SNP位點同時設計兩條有長度差異的探針,當探針末端與模板有一個堿基不配對,所以連接反應不能進行,沒有連接產物;相反,若探針與模板DNA完全互補,故進行連接反應,通過溫控循環,該特異性連接反應可反復進行,達到線性擴增的效果。,后通過熒光掃描片段長度,實現對SNP位點的檢測。美國學者Eric S. Lander于1996年正式提出單核苷酸多態性(SNP)為第三代分子標記.河南SSR基因SNP分型售后服務周到

組成DNA的堿基雖然有4種,但SNP一般只有兩種堿基組成。浙江基因SNP分型分析

上機測序后,每個樣本同一個SNP位置可以讀到數十或數百條reads(具體取決于測序通量),并且能夠清晰看到每條序列的具體信息,通過對SNP位點的聚類分析,實現位點基因型的判斷。大規模樣本中二等位基因reads比分布結果,每一個點一個樣本一個SNP位點的聚類結果,兩端表示純和,中間表示雜合(理想情況,1/0表示純和,0.5表示雜合)。上海翼和應用生物技術有限公司,上海翼和**團隊富有開創精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領下,秉承“專業、協作、進取”的企業精神,為科研用戶提供性價比高、高質量可靠的遺傳學技術服務和產品。微信公眾號:上海翼和生物浙江基因SNP分型分析

上海翼和應用生物技術有限公司發展規模團隊不斷壯大,現有一支專業技術團隊,各種專業設備齊全。致力于創造***的產品與服務,以誠信、敬業、進取為宗旨,以建Biowing產品為目標,努力打造成為同行業中具有影響力的企業。我公司擁有強大的技術實力,多年來一直專注于第三方檢測服務;生物專業領域內的技術開發、技術咨詢、技術服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術服務;生物醫藥行業質控檢測技術技術服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的發展和創新,打造高指標產品和服務。翼和生物始終以質量為發展,把顧客的滿意作為公司發展的動力,致力于為顧客帶來***的細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務。

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