DNA甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5-mC）和少量的N6-甲基嘌呤（N6-mA）及7－甲基鳥嘌呤（7-mG）。結構基因含有很多CPG結構, 2CPG 和2GPC 中兩個胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且兩個甲基集團在DNA 雙鏈大溝中呈特定三維結構。基因組中60%～ 90% 的CPG 都被甲基化, 未甲基化的CPG 成簇地組成CPG 島,位于結構基因啟動子的core序列和轉錄起始點。有實驗證明超甲基化阻遏轉錄的進行。DNA 甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化, 使DNA 失去核酶ö限制性內切酶的切割位點, 以及DNA 酶的敏感位點, 使染色質高度螺旋化, 凝縮成團, 失去轉錄活性。5 位C 甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能導致基因置換突變, 發生堿基錯配: T2G, 如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或cancer, 而且, 生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或tumour,而且,生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。成都全基因組甲基化重測序技術服務

亞硫酸氫鈉修飾后測序法是一種對DNA進行亞硫酸氫鈉處理、聚合酶鏈反應擴增與DNA測序相結合的方法，能夠提供測定區域的序列信息，準確定位甲基化胞嘧啶位點；重亞硫酸鹽修飾后，甲基化胞嘧啶保持不變，但非甲基化胞嘧啶轉變為尿嘧啶，PCR擴增后為胸腺嘧啶，其將甲基化狀態的差異轉化成堿基的差異，從而對胞嘧啶的甲基化狀態進行分析；但在亞硫酸鈉處理的酸性環境下，單鏈特異性PCR模板穩定性下降，容易降解；并且模板鏈CG二核苷酸水平高易形成復雜的二級結構，常出現非特異性條帶，結合“巢式PCR法”能明顯提高擴增的特異度。成都多重PCR技術甲基化重測序分析WGBS的流程與全基因組DNA測序主要區別于DNA文庫的構建。

亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進行化學處理會使甲基化特異性序列變異，從而可以通過NGS進行定位和量化，主要的DNA甲基化數據分析流程：獲得DNA甲基化數據之后，首先，需要對數據進行處理和質量的基本控制，包括原始測序和芯片數據的讀取、轉換到產生準確的DNA甲基化圖譜；其次，需要對DNA甲基化位點的結果進行可視化，并且利用統計學方法鑒定樣本特異性差異的DNA甲基化位點；第三，驗證 DNA 甲基化差異位點，并且對其進行生物學解釋。

WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequence）全基因組甲基化測序，利用重亞硫酸氫鹽使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶(C)脫氨基轉變成尿嘧啶(U)，而甲基化的胞嘧啶保持不變，然后通過PCR將U變為A，*有甲基化的C可以成功保留，***通過測序就可判斷CpG位點是否發生甲基化。特點是精確度高、重復性好，檢測范圍廣，可以覆蓋全基因組范圍內的每一個C堿基的甲基化狀態；但需要的數據量比較大，成本較高。上海翼和生物是上海市遺傳學會理事單位，上海市****，至今已有16年的歷史。WGBS（Whole Genome Bisulfite Sequence）全基因組甲基化測序.

真核生物基因表達受多種機制、多層面的綜合調控。基因的DNA序列不發生改變的情況下，基因的表達水平與功能發生改變，并可遺傳現象，稱為表觀遺傳(epigenetic)現象。DNA甲基化是指在甲基轉移酶的催化下，DNA的CG二核苷酸中的胞嘧啶被選擇性的添加甲基，形成5-甲基胞嘧啶，常見于基因的5′—CG—3′序列。DNA甲基化的位置主要集中在基因5′端的非編碼區，DNA高度甲基化首先會影響DNA結構，進而阻遏基因轉錄，引起基因沉默。人體內，DNA甲基轉移酶主要有四種：DNMT1、DNMT3A、DNMT3B和DNMT3L。在DNA復制完成后，DNMT1是催化甲基轉移至新合成的DNA鏈上，這一現象稱為維持甲基化；DNMT3A和DNMT3B負責催化核酸鏈上新的甲基化位點發生反應，成為形成甲基化；DNMT3L不具有甲級轉移酶活性，其主要作用是調節其他甲基轉移酶的活性。真核細胞內甲基化狀態有3種：持續的低甲基化狀態（如持家基因的甲基化）、誘導的去甲基化狀態（如一些發育階段特異性基因的修飾）和高度甲基化狀態（如人類女性細胞內縊縮-失活的X染色體的甲基化）。DNA甲基化是在DNA甲基化轉移酶的作用下將甲基選擇性地添加到胞嘧啶上形成5-甲基胞嘧啶（5-mC）的過程。南京目標區域甲基化重測序準確度高

常規全基因組甲基化測序技術通過T4-DNA連接酶，在超聲波打斷基因組DNA*段的兩端連接接頭序列。成都全基因組甲基化重測序技術服務

DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾，它是由DNA甲基轉移酶（DNA methyl-transferase, DNMT）催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體，將胞嘧啶轉變為5-甲基胞嘧啶（mC）的一種反應，在真核生物DNA中，5-甲基胞嘧啶是存在的化學性修飾堿基。CG二核苷酸是**主要的甲基化位點，它在基因組中呈不均勻分布，存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的區域，在哺乳動物中mC約占C總量的2－7％。甲基化檢測服務-亞硫酸氫鈉處理后測序法 (bisulfite genomic sequencing PCR, BSP)是利用未甲基化的胞嘧啶可以被亞硫酸氫鈉發生脫氨基變為尿嘧啶的原理，用兩一特異性引物擴增后測序。測序法克服了只能針對單個位點檢測，并且這些位點必須是限制性內切酶識別位點的缺點，可以對任何基因序列的甲基化狀態進行檢測。成都全基因組甲基化重測序技術服務

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