DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能在不改變DNA序列的前提下，改變遺傳表觀。 DNA甲基化在維持細胞正常功能、傳遞基因組印記，胚胎發育、tumour發生等方面發揮重要作用，目前已經成為表觀遺傳學和表觀基因組學的研究熱點。DNA甲基化測序可在全基因組水平上比較大限度的、完整的獲取甲基化狀態信息和與基因表達調控的多重關系，可高效精確完成全基因組甲基化測序及*分辨DNA甲基化譜式繪制，并可對發現的靶點區進行甲基化特異性PCR驗證。重亞硫酸鹽測序可以從單個堿基水平分析基因組中甲基化的胞嘧啶。成都目標區間甲基化重測序技術服務

亞硫酸氫鹽測序法用亞硫酸氫鈉對 DNA 進行化學處理會使甲基化特異性序列變異，從而可以通過NGS進行定位和量化，主要的DNA甲基化數據分析流程：獲得DNA甲基化數據之后，首先，需要對數據進行處理和質量的基本控制，包括原始測序和芯片數據的讀取、轉換到產生準確的DNA甲基化圖譜；其次，需要對DNA甲基化位點的結果進行可視化，并且利用統計學方法鑒定樣本特異性差異的DNA甲基化位點；第三，驗證 DNA 甲基化差異位點，并且對其進行生物學解釋。南京甲基化重測序這種DNA修飾方式在不改變基因序列前提下實現對基因表達的調控。

DNA甲基化即在DNA上增加甲基基團，是使基因的轉錄抑制或沉默的主要方式。該修飾特異性地發生在CpG位點，胞嘧啶通過磷酸鹽與鳥苷酸連接(圖1)。甲基基團的插入改變了DNA的表觀和結構，可能會直接阻礙DNA的識別及與轉錄因子的結合，或者吸引其他因子優先與DNA結合，干擾轉錄因子的結合。目前已鑒定了三個與甲基化DNA結合的蛋白家族，包括MBD蛋白、Kaiso和Kaiso樣蛋白、以及SRA蛋白。通過招募這些蛋白，DNA甲基化可促進某些組蛋白狀態的維持，如去乙酰作用，從而保持轉錄后的組蛋白修飾。例如，MBD家族的甲基CpG結合蛋白2(MeCP2)與甲基CpG結合，招募HDACs，可促使染色體濃縮和轉錄抑制。

DNA甲基化過程在一些生物學現象中起重要作用。例如，在原核生物中，它參與毒力、細胞周期調控、基因表達和對外源 DNA 導入的保護（DNA-宿主特異性）等過程。在高等真核生物中，DNA 甲基化參與調控染色體穩定性、印記、X 染色體失活和cancer 變等多個細胞過程。在哺乳動物中，DNA 甲基化主要發生在胞嘧啶堿基的第五個碳原子上，形成 5-甲基胞嘧啶或 5-甲基胞嘧啶核苷 (5-mC)。DNA甲基化幾乎只存在于CpG二核苷酸上，是一個關鍵的表觀遺傳標記和基因表達調控因子。基因啟動子或 CpG 島處的甲基化 CpG 簇與基因失活有關。DNA 甲基化由一個被稱為 DNA 甲基轉移酶并包括 DNMT1、DNMT3a 和 DNMT3b 的酶家族催化。DNMT3a 和 DNMT3b是從頭合成的甲基轉移酶，能夠甲基化之前未甲基化的 CpG二核苷酸。相反，DNMT1是一種維持性甲基轉移酶，在復制過程中修飾半甲基化的 DNA。DNA甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化,使DNA失去核酶限制性內切酶的切割位點,。

DNA甲基化是指針對DNA序列上的CpG島，由甲基化轉移酶將S腺苷甲硫氨酸的甲基轉移給胞嘧啶。其中，5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一個非常重要的表觀遺傳學修飾事件，該事件能夠調控基因活性，并影響著如細胞分化、轉錄調控和染色質重塑等生物學過程。重亞硫酸鹽測序可以從單個堿基水平分析基因組中甲基化的胞嘧啶。首先，利用重煙硫酸鹽對基因組DNA進行處理，將未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基變成尿嘧啶。而發生了甲基化的胞嘧啶未發生脫氨基，因而，可以基于此將經重亞硫酸鹽處理的和未處理的測序樣本進行比較來發現甲基化的位點。5甲基胞嘧啶 (5-methylcytosine, 5mC)是一種常見的DNA修飾類型，能調節基因表達、轉座子及染色體的狀態等。南京目標區間甲基化重測序準確度高

目標區域甲基化重測序（Hi-Methylseq）結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術。成都目標區間甲基化重測序技術服務

DNA甲基化是在DNA甲基化轉移酶(Dnmt)的作用下將甲基選擇性地添加到胞嘧啶上形成5-胞嘧啶的過程，剛被發現時被定義為第五種堿基，實際上它是一種重要的表觀遺傳學標記，在調控基因表達、維持染色質結構、基因印記、X染色體失活以及胚胎發育等生物學過程中發揮著重大的作用，獲得全基因組范圍內所有C位點的甲基化水平數據，對表觀遺傳學的時空特異性研究具有重要意義，Bisulfite甲基化測序是以新一代高通量測序平臺為基礎，結合全基因組Bisulfite處理和生物信息數據分析技術，進行低成本、高效率、高準確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。成都目標區間甲基化重測序技術服務

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