表觀遺傳學研究已經證實了特定基因區域的DNA甲基化修飾對于染色體構象、基因表達調控機制有著重要影響，而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學為關注的內容之一。Bisulfite處理能夠將基因組中未發生甲基化的C堿基轉換成U，進行PCR擴增后變成T，與原本具有甲基化修飾的C堿基區分開來，再結合高通量測序技術，可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。特定物種的高精確度甲基化修飾模式的分析，必將在表觀基因組學研究中具有里程碑式的意義，并且為細胞分化、組織發育等基礎機制研究，以及動植物育種、人類健康與疾病研究奠定基礎。目標區域甲基化重測序（Hi-Methylseq）結合了亞硫酸鹽轉換、靶向擴增子高通量測序技術。上海甲基化重測序

DNA甲基化主要發生在啟動子區CPG島,在調節基因表達和其他功能方面起著關鍵作用.異常的DNA甲基化可參與調控疾病相關的分子信號通路,從而影響其正常功能。DNA甲基化在生物個體的生長發育與繁殖過程中，維持遺傳物質的穩定性是至關重要的。細胞采用多種機制來保證DNA復制的忠實性，如DNA的雙螺旋結構與半保留復制模式為遺傳物質的穩定提供了物質基礎；DNA聚合酶Ⅲ除了具有DNA聚合酶活性外還具有5’到3’的核酸外切酶活性，可及時去除錯配摻人的堿基；DNA復制后存在多種修復機制進一步保證了遺傳物質的穩定性。DNA甲基化在DNA復制起始、錯配修復、細菌中寄主控制的修飾與限制以及轉座子的失活等過程中對維持遺傳信息的穩定性發揮著重要的作用。安徽目標區段甲基化重測序技術服務亞硫酸氫鹽處理可以使DNA中未發生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變。

全基因組重亞硫酸鹽甲基化測序（WGBS）可以在全基因組范圍內精確的檢測所有單個胞嘧啶堿基（C堿基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金標準。WGBS能為基因組DNA甲基化修飾的研究提供重要技術支持，能廣泛應用在個體發育、衰老和cancer發生等生命過程的機制研究中。其原理是用 Bisulfite 處理DNA序列，首先將基因組中未發生甲基化的 C 堿基轉換成U（T），從而與原本具有甲基化修飾的堿基C區分開來，然后進行PCR擴增，結合高通量測序技術，適用于全基因組范圍內繪制單堿基分辨率的DNA 甲基化圖譜。

DNA甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5-mC）和少量的N6-甲基嘌呤（N6-mA）及7－甲基鳥嘌呤（7-mG）。結構基因含有很多CPG結構, 2CPG 和2GPC 中兩個胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且兩個甲基集團在DNA 雙鏈大溝中呈特定三維結構。基因組中60%～ 90% 的CPG 都被甲基化, 未甲基化的CPG 成簇地組成CPG 島,位于結構基因啟動子的core序列和轉錄起始點。有實驗證明超甲基化阻遏轉錄的進行。DNA 甲基化可引起基因組中相應區域染色質結構變化, 使DNA 失去核酶ö限制性內切酶的切割位點, 以及DNA 酶的敏感位點, 使染色質高度螺旋化, 凝縮成團, 失去轉錄活性。5 位C 甲基化的胞嘧啶脫氨基生成胸腺嘧啶, 由此可能導致基因置換突變, 發生堿基錯配: T2G, 如果在細胞分裂過程中不被糾正,就會誘發遺傳病或cancer, 而且, 生物體甲基化的方式是穩定的, 可遺傳的。重亞硫酸鹽擴增子測序法基于非甲基化胞嘧啶（C）向尿嘧啶（U）的化學轉化，即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA。

DNA甲基化是指在DNA甲基轉移酶的作用下，使胞嘧啶的5位碳原子發生甲基化的生物化學過程。DNA胞嘧啶甲基化是一種穩定的表觀遺傳學標記，在調控特定基因表達、轉座子沉默、基因印記、X染色體失活以及基因組穩定性等多種生物學過程中發揮著重要作用。在動物中，DNA甲基化主要發生在CpG二核苷酸的背景下，約為70-80%的DNA甲基化。然而，剩余未發生甲基化的CpG位點則主要密集分布于基因的啟動子區域和the first exon region，被稱為CpG島(CpG island)，在基因表達的調控和基因突變上都可能發揮著重要作用。甲基化的金標準是亞硫酸氫鹽測序法.河南目標區間甲基化重測序分析

全基因組DNA甲基化測序是用 Bisulfite 處理DNA序列。上海甲基化重測序

DNA甲基化屬于表觀遺傳的范疇。表觀遺傳屬于一種可以對環境產生應答和改變的遺傳機制。機體細胞在經歷脅迫、創傷等環境變化后，會產生特定的應答，并往往會用DNA甲基化、組蛋白修飾等形式將應激的模式記錄在DNA修飾中。這種脅迫記憶可以幫助細胞在面臨下一次應激的時候快速適應。同時，這種表觀修飾可以通過遺傳的方式傳遞給下一代細胞。對于高等動植物，通常壽命都比較漫長。在漫長的一生中，一方面機體會經歷大量的環境應答，另一方面細胞將會分裂多代。那么機體就更需要將應答的信息，存儲在DNA甲基化中傳遞給后代的細胞，以提高這個物種的環境適應能力。上海甲基化重測序

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