了解泊松分布,我們先要從二項式分布說起,二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標實體隨機“投擲”到一組分區中,當目標落在選定的分區中時,就是成功。如果有n個分區,并且分區過程是完全隨機的,則目標出現在所選分區中的概率為1/n。該試驗重復m次,樣品中的每個分子一次。如下所示的二項式分布給出了k個成功的概率,即所選分區恰好包含k個分子的概率。數字PCR通常采用大量分區。當n很大,并且嘗試成功的概率(1/n)很小時,二項分布可以近似為泊松分布。通過“儀器+試劑”相互配合的方式,打出了數字PCR檢測的“組合拳”。華南地區國產數字PCR熒光通道
二項式分布是一個離散概率分布,它給出了m次試驗中k次成功的可能性,每次試驗的概率為p,例如當擲骰子時,二項分布給出了在10次試驗中恰好有7次擲出4的概率。在數字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個目標實體隨機“投擲”到一組分區中,當目標落在選定的分區中時,就是成功。如果有n個分區,并且分區過程是完全隨機的,則目標出現在所選分區中的概率為1/n。該試驗重復m次,樣品中的每個分子一次。更多關于PCR的相關信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學儀器有限公司。珠三角一體化數字PCR技術在數字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無創產前篩查注冊證的申報。
dPCR的結果統計方式有2種,一種是采用標記多種顏色,通過不同檢測通道分辨不同顏色和強度,再根據分散液滴的數量計算待測基因的含量;另一種采用概率統計的數據處理方法,即通過泊松分布的方法對結果進行分析。應用概率統計分析數據和對數據處理方法的模型直接關系著結果的準確性和分析時間的長短。常用的統計方法是假設每個微反應單元的體積相同,根據泊松統計計算拷貝數,公式為:M=-Vx1n(1-x/)其中M是目標總拷貝數量;V是微反應單元數量;x是發光的微反應單元數量。
dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結果偏差。體積誤差對于測量拷貝數濃度會產生偏差。目前dPCR中體積優化方法以光學顯微鏡觀測為主。分散體積的差異會增加拷貝數結果的不確定性,Emslie等使用光學顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數字PCR系統中每個微孔內和孔與孔間的體積差異對實驗結果的影響程度。Corbisier等使用微滴數字PCR對6種不同質量分數棉籽粉質粒DNA標準物質[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進行分析,優化了液滴體積得到相應校正因子,并使用該校正因子發現并校準了運行軟件中液滴體積不變的假設而引起的數據偏離,數據結果的一致性有明顯提高。dPCR儀器在操作中集成了前處理以減少手工移液和樣品轉移的操作,增加了通量,并在價格上具有優勢。
由于現有的商業化數字PCR設備在物理上只設置了2個檢測通道,所以存在一個明顯的短板:不能同時進行多個位點的檢測。在樣品多位點的檢測中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實現多重檢測。為了考察利用數字PCR實現多重檢測的可能性,英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細胞肺相關的KRAS基因為檢測對象,在Bio-Rad的數字PCR系統上通過3個三重ddPCR檢測體系來實現9個KRAS突變位點的檢測。3D數字PCR是基于納米流體芯片進行檢測,通過一次檢測,將樣品分到數千個單獨的PCR。上海國產數字PCR樣品回收
數字PCR具有諸多優點,但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復雜、經濟效益低等。華南地區國產數字PCR熒光通道
數字PCR平臺的評價指標有:分割單元數,熒光通道數,操作復雜性和污染風險。但是重要的是檢測準確性,評估數字PCR平臺的一種方法是使用多個數字PCR平臺互相驗證,另一種方法是使用定值準確的標準物質。目前的三代的PCR技術各有各的優缺點,也各有各的應用領域,并不是一代取代一代的關系。技術的不斷進步給PCR技術注入了新的活力,使其能解鎖一個又一個的應用方向,使核酸檢測更方便、更準確。目前dPCR儀器的價格仍然十分昂貴,但隨著系統加工工藝的改進以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價格將會不斷的降低,使其應用到更多的檢測中。華南地區國產數字PCR熒光通道
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