qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實時積累的熒光信號監測整個擴增過程,然后通過標準曲線來對未知模板進行定量分析。qPCR 主要是依賴于標準品制備標準曲線,進而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法。隨著PCR的循環進行,染料熒光強度增加,從而檢測到定量反應的DNA。SYBR Green是一種DNA插入染料,范圍廣用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好。q225 加樣孔板側壁和金屬熱塊能夠嚴密貼合,使液體樣品迅速達到設定溫度,從而減少實驗時間。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
與標準 PCR 一樣,SYBR Green 方案由變性、退火和延伸階段組成。 不同之處在于,您在 qPCR 設置期間將一些雙鏈 DNA 結合染料 SYBR Green I 添加到預混液中。 這種熒光染料在延伸階段嵌入到雙鏈 DNA 序列中,顯示出熒光信號的強烈增加。 在每個熱循環結束時測量此信號將使您能夠確定存在的雙鏈 DNA 的數量。SYBR Green 檢測的缺點是染料會與任何雙鏈 DNA 序列結合。 這意味著您還可以檢測非特異性 qPCR 產物(例如引物二聚體)發出的熒光。 為消除這種風險,通過執行熔解曲線分析檢查反應特異性,或使用 TaqMan 方法。深圳小巧qPCR儀消毒SYBR Green是一種DNA插入染料用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好。
染色質片段化——DN段化:細胞核材料片段化是獲得良好的ChIP 分辨率的關鍵因素,理想情況下的片段大小在 200 到 800 bp對之間。剪切是難控制的步驟之一。通過超聲處理和/或核酸酶/酶促消化可以實現剪切,各有利弊。超聲處理需要大量的手動操作時間,但非常適合難以裂解的細胞;酶促消化不需要手動操作,適用于大量樣品的處理,但其剪切位點不是隨機的。兩種方法都需要根據具體細胞系進行優化。注意:此時可以停止ChIP。經過剪切/消化染色質后,可以將樣品于-80°C儲存。避免反復凍融。
實時熒光定量PCR所使用的熒光物質可分為兩種:熒光探針和熒光染料。現將其原理簡述如下:1. TaqMan熒光探針:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成完全同步。2. SYBR熒光染料:在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料非特異性地摻入DNA雙鏈后,發射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產物的增加完全同步。SYBR與雙鏈DNA進行結合,因此可以通過溶解曲線,確定PCR反應是否特異。3.分子信標:是一種在5和3末端自身形成一個8個堿基左右的發夾結構的莖環雙標記寡核苷酸探針,兩端的核酸序列互補配對,導致熒光基團與淬滅基團緊緊靠近,不會產生熒光。PCR產物生成后,退火過程中,分子信標中間部分與特定DNA序列配對,熒光基因與淬滅基因分離產生熒光。qPCR 反應所需時間取決于反應溶液進行變溫所需要的時間,這過程受到加熱塊升降溫速度和液體升降溫速度影響。
Quantagene q225 系列熒光定量PCR 系統主要特點:精確定量 以可靠的數據助力您的研究。采用擬合算法計算 Ct 值,定量誤差不超過±10%。液體冷卻循環系統確保孔間溫度高度一致,溫差不超過 ±0.15°C。光學系統無運動部件,穩定性增加,長期使用無需校準與維護。的儀器間重復性,不同位置、不同反應體積均不影響定量結果。快速高效 用更短的時間獲得更多數據。40 個循環的常規 qPCR 只需43 分鐘,較常見qPCR 儀多縮短60% 的時間。在提高速度的同時保持了96 孔的高通量,滿足絕大多數實驗需求。小巧輕便 節省空間及您的寶貴樣品小體積為移動實驗和大量部署提供可能。5-10 μl 的推薦反應體積,較常規實驗節省80%的試劑用量,更節約您的珍貴樣品。PCR反應需要五種關鍵試劑:PCR模板、DNA聚合酶、引物、脫氧核苷酸三磷酸(dNTPs)、PCR緩沖液。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
與標準 PCR 一樣,SYBR Green 方案由變性、退火和延伸階段組成。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
實時熒光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qPCR)通過在普通 PCR 反應體系中加入了熒光標記探針或熒光染料,利用熒光信號的變化實時檢測PCR擴增反應中每一個循環擴增產物變化。通過熒光強度變化監測產物量的變化,從而得到一條熒光擴增曲線圖。具有專一性更高、可實時監控、可重復精確定量等優勢。qPCR的種類根據qPCR的化學發光原理一般分為2大類:一類是探針法,利用與靶序列特異雜交的探針來指示擴增產物的增加;一類是基于SYBR Green I 的染料法,通過熒光染料來指示產物的增加。廣東Quantagene q225mxqPCR儀儀器
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