基于SnapGene軟件的多序列比對教程-生命科學軟件打開SnapGene,直接將txt拖入snapgene起始界面。SnapGene將自動識別txt中的每個序列,并將其拆分成為單獨的序列文件,點擊“Import”,軟件將生成一個文件夾,文件夾中含有txt中的每一個FASTA序列。-生命科學軟件用SnapGene打開任意一個序列(推薦打開文件大小比較大的),選擇Tools菜單欄中的“AlignMultipleSequences”功能(快捷鍵Ctrl+L)在彈出的窗口中,將剩下幾個序列都選中,點擊“打開”,SnapGene將對選中的序列進行多重比對生命科學不容錯過的App。廣東報表制作生命科學軟件試用
對該序列進行注釋:點擊Features→AddFeature,對該序列進行命名注釋。△創建質粒圖譜文件方法相同。-生命科學軟件處理序列翻譯信息1.創建一個DNA序列文件,點擊按鈕-生命科學軟件黃色箭頭**的是上面一條鏈編碼序列,綠色箭頭**的是下面一條鏈編碼序列。3.點擊Sequence,點擊右側箭頭,選擇All6Frames,可得到編碼序列的所有情況,其中**的是終止密碼子。4.添加內含子:根據內含子的位置,點擊Edit→SelectRange,輸入內含子堿基位置。點擊Features→DeleteFeatureSegment四川Geneious生命科學軟件哪家好生命科學軟件有哪些特點呢。
將序列粘貼到序列框中,同理更改名字以及添加酶切位點序列(下游酶切位點是BamHI)和保護堿基的序列,然后點擊“addprimertotemplate”-生命科學軟件點擊“Map”,Ctrl鍵選擇兩個引物(如圖),點擊“Action”→“PCR”點擊“PCR”,即獲得擴增產物-生命科學軟件打開表達載體序列,按Ctrl鍵選擇兩個酶切位點(藍色標記的),點擊“Action”→“Restrictioncloning”→“Insertfragment”點擊“Insert”,選擇剛剛擴增產物的文件“A”,然后分別輸入相應內切酶的名字,點擊插入的片段。在右下角點擊“Clone”即可。
生命科學軟件對片段進項注釋。給編碼序列命名:點擊其中一個箭頭,按Feature→AddTranslatedFeature,Feature:給該片段命名。Type:選擇該片段的類型,右側箭頭**閱讀方向。Color:選擇顏色。給非編碼序列命名:如多克隆位點。先找到質粒圖譜中的多克隆位點的***個酶切位點和***一個酶切位點。點擊左側sequence,找到兩個酶切位點之間的序列。-生命科學軟件sequence按鈕3.給質粒圖譜增加引物序列:按Edit→Find,輸入引物序列,找到質粒序列對應位置,點擊Primers→Addprimer生命科學軟件 - QuickPHOTO。
得到的結果如下圖所示。下圖中顯示的酶是能夠切斷目的基因的酶,因此要排除。所以我們剩下的可以選擇的酶包括Nde1,EcoR1,Pst1共3種酶。下一步打開載體DNA文件。-生命科學軟件打開載體以pGADT7AD為例,查看切入位點的酶有哪些。在篩選的過程中還要注意酶切位點不能把基因切斷。因此在選擇酶切位點時候要保證兩點。1.載體中多克隆位點中包含該限制性內切酶。2.目標基因可酶切的位置不包含該限制性內切酶。點擊圖中標記的地方MCS(多克隆位點)插入基因的位置。-生命科學軟件。常用生物學軟件介紹。江蘇圖表制作生命科學軟件哪家好
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showenzymes:顯示酶切位點,下拉含有多個操作按鈕,分別顯示序列中不同個數的酶切位點,亦或者顯示序列不含的酶切位點,深黑色的是單一的酶切位點,淺色的為多切位點,可快速查詢酶及識別序列。-生命科學軟件showfeatures:顯示/隱藏功能序列,某些序列如果含有的功能片段較多,顯得較為凌亂,可以點此操作。showtranslation:顯示/預測翻譯,顯示序列可能的編碼區(可下拉調整參數),該功能為預測功能,使用需要結合序列本身的特征或者對序列有一定的了解,也可借助此功能快速預測lncRNA、circRNA等潛在的編碼區,十分實用!-生命科學軟件use3letteraminoacidcodes:顯示氨基酸密碼子的呈現顯示,如Asp—D轉換。廣東報表制作生命科學軟件試用