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江蘇蛋白組學 數據分析

來源: 發布時間:2022-07-15

綜上所述,本研究應用RNA-seq轉錄組分析結合iTRAQ蛋白質組學技術,探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態變化。此外,作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調控機制。許多功能轉錄本(16530)和蛋白質物種(1228)的模式發生了***變化,其中317個DAPs被轉錄組結果覆蓋。結合結構基因(蛋白)或轉錄因子的表達譜及相應化合物的含量,對重要代謝產物的調控網絡進行了探討。結果表明,黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。4D-蛋白組+代謝組雙平臺知識干貨帶您。江蘇蛋白組學 數據分析

蛋白質磷酸化修飾是指在磷酸化激酶的作用下將ATP的磷酸基轉移到蛋白質特定氨基酸上的過程,是生物體內**為常見、**為重要的翻譯后修飾之一。生物體內蛋白質的磷酸化修飾是一個瞬時且可逆的過程,通過磷酸化修飾可以改變蛋白質空間構象,從而影響蛋白質的定位、活性及其與其他蛋白的相互作用上海鹿明生物科技有限公司多年來,一直專注于生命科學和生命技術領域,是國內早期開展以蛋白組學和代謝組學為基礎的多層組學整合實驗與分析的團隊。影響因子:13.511發表時間:2022-01-06發表單位:***醫學研究院生物工程研究所運用生物技術:磷酸化蛋白質組學(歐易鹿明提供)、LC-MS靶向代謝組學吉林蛋白組學概念修飾蛋白質組試-蛋白質組學 解決方案。

iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法:2021年7月,海南大學園藝園林學院吳友根教授課題組等在《Horticulture Research》期刊發表了題為“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果,通過RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學技術研究方法,發現了油茶種子成熟過程中與油質相關關鍵代謝產物的積累模式特征,探究了不同成熟度油茶轉錄組和蛋白質組譜機理,描繪了海南油茶種子成熟過程的動態變化圖譜。為該樹種的遺傳改良提供了理論依據。

label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。肺腺*(lungadenocarcinoma,LUAD)是肺*的一種,屬于非小細胞*,早期一般沒有明顯的臨床癥狀,且易發生轉移。肺腺*(LUAD)的基因組研究提高了對該**生物學的理解,加速了靶向***的進程。中國科學家選取了103例未經***的中國肺腺*患者的原位肺腺*組織及其相應的*旁組織(NAT)(樣本策略),利用基于質譜的label-free蛋白定量策略進行蛋白組學的***分析。從多維度揭示疾病重要分子特征對蛋白質組、磷酸化蛋白質組、轉錄組和全外顯子組測序數據的綜合分析揭示了**相關特征,如**相關蛋白變異、特有的蛋白質組特征以及早期患者或EGFR和TP53突變患者的臨床結果。蛋白組學近期研究進展的盤點。

為了驗證iTRAQ標記蛋白組學分析測定的蛋白積累變化,選擇兩種蛋白進行westernblot分析。如圖4A所示,iTRAQ分析中兩種蛋白(RPD3和VMA3)的積累每次均與westernblot數據一致。RPD3、TOR1、VMA3和VAC8在基因水平上的相對表達量與蛋白水平相似,在BF的菌絲中也表達上調(圖4B-D)。VAC8在2-1、3-1、4-1組的基因水平上高度上調。這些結果表明,這些上調的表達蛋白可能是香菇BF形成的重要蛋白。本研究利用標記定量(iTRAQ)蛋白質組學、基于氣相色譜-質譜的代謝組學GC-MS非靶向代謝組學和透射電鏡分析細胞結構,研究了香菇菌絲后熟轉色形成的機制,并且***證明氧化應激和自噬過程是至關重要,為后續進一步的研究提供了新的見解。修飾蛋白質組試劑及服務,蛋白質組學解決方案。江蘇化學蛋白組學

質譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質組學 。江蘇蛋白組學 數據分析

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