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福建蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-02

本研究采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽(TMT)標(biāo)記的蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)技術(shù),對蓮子脫水過程中的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了深入研究表明,碳水化合物代謝(包括糖酵解/糖異成、半乳糖代謝、淀粉和蔗糖代謝、磷酸戊糖途徑和細(xì)胞壁組織)、ER中的蛋白質(zhì)加工、DNA修復(fù)和抗氧化事件對蓮種胎脫水有積極的反應(yīng)。在蓮種胚脫水過程中,非酶促抗氧化劑和戊糖磷酸和維生素E作為主要的抗氧化劑,在脫水過程中維持荷花胚胎的REDOX平衡。這些結(jié)果為揭示荷花胚胎脫水保護(hù)機(jī)制的生理學(xué)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了酶途徑在抗氧化保護(hù)中起著主要作用。應(yīng)激生理學(xué)檢測表明,H2O2是誘發(fā)氧化應(yīng)激損傷的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的見解。歐易鹿明生物蛋白質(zhì)研究技術(shù)。福建蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)

隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個(gè)新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì),也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。福建蛋白組學(xué) 武漢公司扎根蛋白組學(xué)臨床科研基礎(chǔ)研究領(lǐng)域,多年項(xiàng)目服務(wù)經(jīng)驗(yàn)。

在本研究中,利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發(fā)育過程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期:在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值,同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過程中具有主導(dǎo)作用。

TMTpro-16plex等標(biāo)記試劑已經(jīng)發(fā)布一年,廣受科研工作者喜愛。但是,對于6組3重復(fù)、3組6重復(fù)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),16plex卻難以滿足。TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組會是更好的選擇方式。其中基于質(zhì)譜儀平臺的蛋白組學(xué)近年來備受青睞,穩(wěn)定同位素標(biāo)記策略也被廣泛應(yīng)用于多重定量蛋白質(zhì)組學(xué)中。鹿明生物推出Thermo Scientific? TMTpro? 18-plex標(biāo)記蛋白組,18個(gè)樣本以內(nèi),可實(shí)現(xiàn)一次標(biāo)記和分級,避免了多批次標(biāo)記引入的批次效應(yīng),能***提升樣本的數(shù)據(jù)質(zhì)量。同時(shí)對更多蛋白質(zhì)鑒定和定量,提供了樣本的多通路處理水平。這個(gè)技術(shù)可謂是2021年的又一創(chuàng)新技術(shù)。蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學(xué)聯(lián)合分析。

采用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對三個(gè)脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析,共鑒定了5,477個(gè)蛋白質(zhì)。對測試樣本進(jìn)行了PCA分析,結(jié)果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個(gè)重復(fù)樣本被聚集在一起。PCA的前兩個(gè)成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個(gè)試驗(yàn)組之間共有815個(gè)差異表達(dá)蛋白。其中,198個(gè)(32%)和198個(gè)(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(gè)(68%)和558個(gè)(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個(gè)蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。蛋白質(zhì)組學(xué)的特點(diǎn)蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。福建蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)

單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。福建蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)

2021年10月,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在《Ecotoxicology and Environmental Safety》(IF:6.291)發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法,探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(簡稱:DON,俗稱嘔吐***)對成肌細(xì)胞分化的影響,發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細(xì)胞骨架蛋白和細(xì)胞外基質(zhì)蛋白表達(dá)下調(diào),并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機(jī)理,為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。其中轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持。福建蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠實(shí)可信的企業(yè)。歐易生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗(yàn)。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。

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