iTRAQ標記蛋白組學研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農業大學孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標記蛋白組學+轉錄組學研究方法,探究了莖尖分生組織的形態對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標題:iTRAQ標記蛋白質組學分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象:白菜型冬油菜發表期刊:ScientificReports影響因子:4.17蛋白組學研究必看的經典綜述。廣東蛋白組學和基因組學的差異
采用TMT標記定量蛋白質組學技術對三個脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進行了蛋白質組學分析,共鑒定了5,477個蛋白質。對測試樣本進行了PCA分析,結果顯示,不同組間樣品具有很好的區分,每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中,198個(32%)和198個(26%)蛋白質豐度增加,而420個(68%)和558個(74%)蛋白質豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個蛋白質的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。福建做蛋白組學多少錢一站式服務,研究不同生物體在不同時刻/狀態下蛋白質表達的變化。
運用生物技術:磷酸化蛋白質組學(歐易鹿明提供):2022年1月,***醫學研究院生物工程研究所鐘輝研究員、魏從文副研究員和秦成峰研究員,廣西醫科大學附屬**醫院吳飛翔教授等為共同通訊作(一作:萬祿明、鄧永強、柯躍華、麻恩浩、楊歡、林浩天)在Nature Metabolism期刊發表的題為“GP73 is a glucogenic hormone contributing to SARS-CoV-2-induced hyperglycemia”的研究成果,通過磷酸化蛋白質組學、LC-MS靶向代謝組學等研究方法,發現了一個全新的糖異生調控***——GP73,***會誘導GP73的產生和分泌,從而導致過度的糖異生。
作者進行了綜合分析,將蛋白組學和代謝組學中的***生物標志物合并到通路分析中,并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉化、檸檬酸鹽循環和**酸代謝這幾種途徑。然后結合蛋白質和代謝標志物來預測DKD狀態。五種機器學習模型表明,組合模型提高了DKD預測的準確性和穩定性。圖中展示了RF的結果。總的來說,組合多組學標志物模型是一種強有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學結果表明,α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進展的潛在生物標志物。2.代謝組學結果表明,半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑,此外甘油-3-半乳糖苷可作為預測DKD的**標志物。3.蛋白組學和代謝組學的組合可以提高預測和診斷DKD的準確性和穩定性。血清綜合組學的生物標志物可用于DKD的預警和診斷。該研究為優化DKD的管理提供了數據資源。蛋白組學技術對腎錯構瘤尿液差異蛋白的研究。
蛋白質是生命活動的主要執行者,而蛋白質磷酸化修飾是生物體內**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內有超過三分之一的蛋白可以發生磷酸化修飾。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及**發生等過程在內的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質組學只能解釋蛋白磷酸化水平發生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質組與磷酸化蛋白質組聯合分析,則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發揮了更加重要的作用。單細胞蛋白組學之質譜流式細胞技術 。安徽定量蛋白組學價格
蛋白質組學測序 蛋白組學技術缺點。廣東蛋白組學和基因組學的差異
本研究通過生理和蛋白質組學分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標記蛋白組學和轉錄組學分析,揭示了谷胱甘肽轉移酶活性、碳水化合物結合和谷胱甘肽結合、代謝過程及IAA反應與冷應激反應密切相關,鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發揮了重要作用。廣東蛋白組學和基因組學的差異
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