2021年12月，南京農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學學院楊倩教授及生命科學學院林建副教授，于Cell＆Bioscience(IF:7.133) 在線發(fā)表了IBDV ***雞法氏囊的單細胞測序的***研究成果。研究工作內容的主要承擔者為Abid Ullah Shah博士。歐易生物提供高通量單細胞轉錄組測序（10x Genoimics單細胞轉錄組測序）技術支持。該研究從雞傳染性法氏囊病毒的鼻腔***入手，一方面***闡述了IBDV 通過雞鼻腔傳播至法氏囊的傳播途徑及病毒***主要靶細胞；另一方面，研究初步闡明家禽細胞應用RNAi抵抗IBDV的分子機制，為高效防控家禽RNA病毒奠定理論基礎。單細胞測序數(shù)據(jù)的背景噪聲大。單個細胞 RNA 含量很少，擴增和捕獲效率的微小變化。重慶效果單細胞測序

單細胞懸液制備難于標準化。

基于酶學的樣本處理方法，大都會存在一定程度的解離偏好性，即不同的酶處理不同的組織往往會有不太一樣的「效果」，而這種效果不僅*反應在細胞得率，細胞活性和細胞碎片等參數(shù)上，往往也會在**終細胞類型有所反映，比如可能會導致部分稀有細胞的丟失，細胞比例的失真等，從而偏離組織的真實狀態(tài)。另外，細胞懸液的制備過程較長，通常需要3-5小時，這個過程會導致細胞處于「應激狀態(tài)」中，轉錄的過程可能已經(jīng)發(fā)生變化，偏離臨床實驗的終點設計，會對結果的判斷造成一定的影響。針對如上問題，歐易團隊從已發(fā)表的高影響力的文獻中，匯總出針對不同類型組織的處理方法，確保實驗結果與文獻并軌（同頻）。對于應激問題，我們也開發(fā)出了低溫解離方法，使樣本始終處于「休眠」狀態(tài)，從而保證了樣本符合臨床取樣終點，還原其生物學的真實狀態(tài)。另外細胞核測序也是一個替代的選擇，對樣本的要求較低，可以解鎖大量臨床信息明確、低溫冷凍的標本。細胞核制備也不依賴于酶學，全程在低溫環(huán)境，也能真實還原樣本的臨床狀態(tài)。歐易在細胞核測序的核懸液準備上積累了很多經(jīng)驗。 安徽效果單細胞測序單細胞蛋白組和代謝組受制于質譜儀器的靈敏度，目前還存在一定的難度。

肝*是全球**相關死亡的第四大原因，肝細胞*（HCC）是肝*的主要形式。目前對于肝*的***手段通常是手術切除，但較高的術后復發(fā)率降低了患者的生存率，尤其是術后 2 年內的早期復發(fā)占整體 HCC 復發(fā)病例的 70%。本研究中作者通過單細胞轉錄組測序對原發(fā)及早期復發(fā)性 HCC 患者的**微環(huán)境進行深入探索，試圖發(fā)現(xiàn)更有效的***策略。 材料：原發(fā)及早期復發(fā)性肝細胞***及配對*旁組織 期刊：Cell 方法：MIRALCS, 10x Genomics 影響因子：38.635 研究目的：描述原發(fā)及早期復發(fā)性 HCC **微環(huán)境特征。

歐易生物單細胞測序近期高分文章不斷，在接下來的幾篇單細胞文獻解讀軟文里，我們將為大家持續(xù)送上近期合作發(fā)表的單細胞文獻解讀。本篇文章為大家解讀今年5月由上海交通大學附屬上海市第一人民醫(yī)院劉堃團隊在Diabetes(IF9.461)期刊發(fā)表的關于2型糖尿病小鼠視網(wǎng)膜組織的分子圖譜和異質性的相關成果。

材料：3只2型糖尿病模型小鼠(db/db)；3只對照小鼠(db/m)的視網(wǎng)膜組織

期刊：Diabetes

發(fā)表時間：2021年5月

方法：歐易生物10xGenomicsscRNA-seq 早期受技術限制，單細胞層面的研究往往***在單個細胞或者微量群體細胞水平，能夠檢測到的信息相對有限。

h5Seurat 文件格式是專門為存儲和分析多模態(tài)單細胞和空間表達數(shù)據(jù)而設計的，比如 CITE-seq 或 10X Visium 技術。它能夠保存所有分子信息和相關描述的數(shù)據(jù)，包括降維信息、空間坐標以及細胞群標簽等。HDF  是用于存儲和分發(fā)科學數(shù)據(jù)的一種自我描述、多對象文件格式。HDF  由美國國家超級計算應用中心（NCSA）創(chuàng)建，以滿足不同群體的科學家在不同工程項目領域之需要。后來由一個非盈利組織 HDF Group 支持，其版本包括了 HDF4 和現(xiàn)在大量使用的 HDF5。過去 5 年里，單細胞測序技術的快速發(fā)展極大地加速了生物醫(yī)學領域的相關研究。陜西單細胞測序報價

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