iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)組學(xué)三大基本技術(shù)。北京蛋白組學(xué)是不是熱門
作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻酰化下調(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會(huì)減少NDP和NUP的N-豆蔻酰化，而過表達(dá)NMT1會(huì)誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻酰化（圖2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會(huì)導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化，這可以通過在肝臟中表達(dá)外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對NDP和NUP的表達(dá)起著相反的作用，但NMT1同時(shí)刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)檢測一次多少錢走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。
蛋白組學(xué)技術(shù)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高，覆蓋度廣的優(yōu)點(diǎn)。DIA蛋白組學(xué)技術(shù)已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學(xué)技術(shù)分析了8個(gè)SAPHO病人和8個(gè)健康人的蛋白表達(dá)譜。蛋白表達(dá)的相關(guān)性圖顯示組內(nèi)相關(guān)性良好，差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學(xué)通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化，從而推動(dòng)疾病的病理機(jī)制研究，為臨床診斷和預(yù)后提供潛在生物標(biāo)志物。
TMT蛋白質(zhì)組學(xué)探究案例：2021年9月，安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果，通過TMT蛋白質(zhì)組學(xué)和泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應(yīng)的差異表達(dá)蛋白和泛素化蛋白質(zhì)，為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解，為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。定量蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)進(jìn)行質(zhì)譜檢測未知蛋白進(jìn)行全檢測。
本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強(qiáng)的機(jī)理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān)，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs，這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝，對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。蛋白質(zhì)組學(xué),蛋白質(zhì)組分析,專業(yè)的多組學(xué)聯(lián)合分析。廣東蛋白組學(xué)四代
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在本研究中，利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類分析顯示，在種子發(fā)育過程中，轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中，花后70天（種子發(fā)育活躍期）是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期：在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值，同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置，在脂肪酸的合成過程中具有主導(dǎo)作用。北京蛋白組學(xué)是不是熱門
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