TMT標記定量蛋白組學研究案例：2021年11月，南京中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院單位（一作劉史佳研究員）及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果，通過TMT標記定量蛋白組學和GC-MS非靶代謝組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎病（DKD）特征，篩選了蛋白和代謝容組合生物標志物。為優(yōu)化糖尿病腎病（DKD）管理提供了豐富且開放訪問的數(shù)據(jù)資源。中文標題：血清綜合組學揭示人類糖尿病腎病情況研究對象：人血清發(fā)表期刊：MolecularMetabolism影響因子：7.422發(fā)表時間：2021年11月1日合作單位：江蘇省中醫(yī)院運用生物技術(shù)：TMT標記定量蛋白質(zhì)組學、GC-MS非靶向代謝組學(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA單細胞組學 單細胞蛋白組學 蛋白質(zhì)組學 。福建蛋白組學方法
采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學分析和DIA蛋白質(zhì)組學分析，研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中，2837個（約16.9%）在正常組和對照組之間有***差異，表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比，共有3749個基因因攝入AC而發(fā)生***改變（2201個下調(diào)，1548個上調(diào)），560個基因（430個下調(diào)，130個上調(diào)）因攝入AL而發(fā)生***改變（圖3B）。DIA蛋白質(zhì)組學分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個（約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%）DEPs，AC處理有230個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（109個上調(diào)，121個下調(diào)），AL處理有211個蛋白質(zhì)發(fā)生***變化（116個上調(diào)，95個下調(diào)）。福建蛋白組學檢測價格蛋白組學檢測一個樣多少錢。
iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法：2021年4月，南京林業(yè)大學喻方圓教授（一作：吳岐奎）課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學+iTRAQ標記定量蛋白組學研究方法，分析東京野茉莉種子發(fā)育過程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達趨勢，確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎。
本文為了探究其潛在的分子機制，作者運用RNA測序（RNA-seq）和iTRAQ標記定量蛋白組學，對不同成熟度水平的油脂種子進行了研究。不僅揭示了關(guān)鍵候選基因和蛋白質(zhì)的時間特異性表達，而且為該樹種的遺傳改良提供了科學依據(jù)。中文標題：基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學和轉(zhuǎn)錄組學聯(lián)合分析揭示油茶種子成熟過程中油質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物的積累研究對象：油茶種子發(fā)表期刊：HorticultureResearch影響因子：6.793發(fā)表時間：2021.07.01發(fā)表單位：海南大學園藝園林學院運用生物技術(shù)：RNA測序(RNA-seq)和iTRAQ標記定量蛋白組學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白組學文章中iTRAQ標記定量蛋白組學由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持蛋白質(zhì)組學 找歐易生物-生物標志物、機制研究一站式服務。
蛋白組學研究案例：2022年1月，歐易/鹿明生物合作客戶北京中醫(yī)藥大學教育部中醫(yī)養(yǎng)生學重點實驗室劉銅華教授課題組在Frontiers in Nutrition期刊發(fā)表了題為 “Mechanisms for Improving Hepatic Glucolipid Metabolism by Cinnamic Acid and Cinnamic Aldehyde: An Insight Provided by Multi-Omics ”的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究方法，發(fā)現(xiàn)了肉桂酸（AC）和肉桂醛（AL）在改善葡萄糖脂代謝中的特征，探究了其代謝作用機理。為預防和***代謝紊亂等疾病提供了理論依據(jù)。質(zhì)譜技術(shù),生物信息學方法,提供蛋白質(zhì)組學 。浙江蛋白組學平臺建設
歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。福建蛋白組學方法
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì)，磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點。基因組確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因（圖1A）。與西方iCCA人群隊列相比，本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率（圖1B）。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征（圖1C）。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)（圖1E）。進一步分析顯示，TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)（圖1F和1G）。福建蛋白組學方法
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