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安徽磷酸化蛋白組學

來源: 發布時間:2022-10-31

隨著質譜技術的飛速發展,特別是離子淌度的引入,增加了一個新的分離維度,將蛋白質組研究推進到全新的“4D蛋白質組”層面,打破了基于質譜的蛋白質組學研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測靈敏度,帶來蛋白質組學在鑒定深度、檢測周期、定量準確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊列、復雜體系以及微量樣本的檢測。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經過簡化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學建立了新的標準。CCS 值的加入讓組學結果更精細,也使timsTOF Pro 2成為轉化組學應用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠實現少量細胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質組學分析,在短梯度下實現蛋白深度覆蓋。蛋白組學方案為組學研究涉及的樣本獲取,前處理,數據采集到分析的各個環節提供自動化。安徽磷酸化蛋白組學

iTRAQ標記蛋白組學研究方法:2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農業大學孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果,通過iTRAQ標記蛋白組學+轉錄組學研究方法,探究了莖尖分生組織的形態對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標題:iTRAQ標記蛋白質組學分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象:白菜型冬油菜發表期刊:ScientificReports影響因子:4.17江蘇生信分析 蛋白組學label free蛋白組學蛋白質組學原理。

DIA蛋白組學:SAPHO綜合征是一種侵犯皮膚和骨骼的炎癥性疾病,其發病率低,表現形式多樣,診斷困難。2022年1月,由北京中醫藥大學課題組在J Proteomics.期刊發表的題為“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,通過DIA蛋白組學研究方法,***揭示了SAPHO患者的血清蛋白質組譜,為疾病診斷提供了潛在的生物標志物。同時作者發現補體系統抑制劑如CFH和C4BP在SAPHO綜合征中表達上調,這可能在SAPHO綜合征的發病機制中發揮重要作用。

采用RNA-Seq轉錄組學分析和DIA蛋白質組學分析,研究了AC和AL對db/db小鼠的影響。轉錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質編碼轉錄本。其中,2837個(約16.9%)在正常組和對照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉錄水平上與野生型小鼠***不同。與對照組相比,共有3749個基因因攝入AC而發生***改變(2201個下調,1548個上調),560個基因(430個下調,130個上調)因攝入AL而發生***改變(圖3B)。DIA蛋白質組學分析鑒定出2729種蛋白質。正常組和對照組之間共發現1059個(約占總鑒定蛋白質的38.8%)DEPs,AC處理有230個蛋白質發生***變化(109個上調,121個下調),AL處理有211個蛋白質發生***變化(116個上調,95個下調)。蛋白質組學生物標志物&機制研究一站式服務。

蛋白質是生命活動的主要執行者,而蛋白質磷酸化修飾是生物體內**重要的共價修飾方式之一,真核生物體內有超過三分之一的蛋白可以發生磷酸化修飾。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程調節著包括細胞增殖、發育、分化、信號轉導、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮及**發生等過程在內的所有生命活動。單一的磷酸化蛋白質組學只能解釋蛋白磷酸化水平發生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質組與磷酸化蛋白質組聯合分析,則在揭示疾病相關特性、篩選疾病生物標志物、尋找藥物靶點等方面發揮了更加重要的作用。蛋白質組學測序 蛋白組學技術缺點。北京蛋白組學研究路線及研究技術

歐易鹿明生物基于質譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質組學。安徽磷酸化蛋白組學

本研究通過生理和蛋白質組學分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料,通過iTRAQ標記蛋白組學和轉錄組學分析,揭示了谷胱甘肽轉移酶活性、碳水化合物結合和谷胱甘肽結合、代謝過程及IAA反應與冷應激反應密切相關,鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs,這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質和能量代謝,對提高冬油菜的耐凍性發揮了重要作用。安徽磷酸化蛋白組學

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