空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系(BCL)進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析,發現MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達,在MYC誘導的肝細胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細胞*(RCC)的三種體內轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發現MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發現與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達,但不降低MYC基因的表達。其次,ChIP的MYC與啟動子結合,不僅調節FA合成基因的表達,還調節糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此,MYC似乎會依次調節參與脂質合成的基因:首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序(RNA-seq)發現,增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空間代謝組學一個樣本多少錢。海南空間代謝組學英文
通過空間代謝組學檢測到正常腎臟與MYC誘導的**之間的GPs豐度(m/z:700–1000),發現兩組存在***差異,尤其是m/z在865的***增加。?;鶄孺溳^短(18個碳或更少)的PG在MYC***的前15天呈現增加趨勢,然后開始減少,但酰基側鏈較長的PG含量持續增加(圖 5)。MYC失活后,這些差異在很大程度上是可逆的。通過體外實驗證明,MYC的誘導和MYC失活能夠增加和降低了PG合成基因的mRNA(圖6C)。并且MYC活化還上調了FA延長酶ELOVL2和ELOVL6的mRNA表達豐度(圖6D)。結果顯示,MYC參與調節FA生成和相關基因的表達。海南空間代謝組學英文空間代謝組學哪家好,為各類科學領域提供線索和方向。
AFADESI-MSI空間代謝組學:中文標題:一種基于分子組織學的高靈敏高覆蓋質譜成像方法用于檢測功能性代謝物研究對象:大鼠腎臟,大鼠腦和人食道*組織發表期刊:AdvancedScience影響因子:16.806運用生物技術:AFADESI-MSI空間代謝組學2018年11月中國醫學科學院藥物研究所再帕爾·阿不力孜教授、賀玖明研究員課題組在Advanced Science發表的研究論文,通過優化的空氣動力輔助解吸電噴霧質譜成像(AFADESI-MSI)技術,繪制了生物樣本中超過1500種代謝物的空間分布圖譜,將功能代謝物的時空變化與組織結構和生物功能聯系起來。本研究開發了一種靈敏且覆蓋度廣的AFADESI-MSI方法,用于原位分析組織上的代謝物并發現特異性生物標志物。通過非靶向分析,在大鼠腦、腎臟和人食道*組織中觀察到數千種代謝物,為分子組織學研究提供了有力的分析工具。
空間代謝組學:利用基質進行空間成像——MALDI質譜分子成像技術MALDI-MSI分析中非常關鍵的一點是需要添加基質來吸收激光能量,實現被測物的離子化,主要對脂質類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達到數個微米。其中,MALDI和DESI成像技術目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術。這兩種技術與質譜相連,使用范圍有一定的互補性。二者結合使用,可實現“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點呢?質譜成像技術可以實現生物組織中上千代謝物的定性。
隊列1:收集手術切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發現食管腺*發展進程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結合H&E染色。研究方法:空間代謝組學;qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達;細胞轉染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達??臻g代謝組學,代謝組數據庫。安徽空間代謝組學的n要多少
空間代謝組學的力量探究前列腺*。海南空間代謝組學英文
本篇小鹿分享一篇空間代謝組學專業應用技術文章,探究空間代謝組學如何進行前列腺*診斷和預后生物標志物的差異研究?該研究發現了前列腺*樣本中的特定組織區室的不同代謝特征,確定了幾種可能被進一步開發為前列腺*的診斷和預后生物標志物的差異代謝物和脂質。空間代謝組學能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息,是臨床上有潛力的創新診斷工具。免標記、無需基質噴涂、周期短、定位準是AFADESI空間代謝組技術的主要特點。該技術作為一種新型的分子影像技術,能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。海南空間代謝組學英文
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