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河北空間代謝組學公司

來源: 發布時間:2023-03-01

隊列1:收集手術切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發現食管腺*發展進程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結合H&E染色。研究方法:空間代謝組學;qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達;細胞轉染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達。曾經錯過熱潮—空間轉錄組,別再錯過新秀—空間代謝組。河北空間代謝組學公司

1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示,將大鼠大腦連續矢狀切面通過ESI探針對逐個像素進行掃描,并將解吸的代謝物離子傳輸到高分辨率質量分析儀進行分析。圖1E是大鼠腦部某個像素點的一個代表性質譜圖,在該圖中可以觀察到數千個代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產物圖像,在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區域具有特定分布。這些異質代謝分布與大鼠腦的功能和結構復雜性高度一致。實驗結果表明,AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm,代謝物質量比較大差異為0.001Da,同一物質的檢測動態范圍高達1000倍。如圖1所示,通過AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物,其強度范圍從0到104甚至到106。湖北空間代謝組學 英語空間分辨代謝組學代謝組相關材料。

空間代謝組學:在大鼠腦繪制特定區域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負離子模式下分別獲得298個和372個微區輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結合同位素豐度,通過人類代謝組數據庫(HMDB)對離子圖像進行識別,鑒定出多種內源極性代謝物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經遞質等。***系統(CNS)的特定功能和特定解剖區域相關。例如,乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達;γ-氨基丁酸是一種抑制性神經遞質,其在大腦皮層的信號強度較低,在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。

本文作者開發的一種基于敞開式空氣動力輔助解吸電噴霧離子化質譜成像(AFADESI-MSI)的空間代謝組學技術,可以實現大腦功能區域小分子極性代謝物的檢測,發掘微區特定代謝途徑的變化;結合代謝網絡映射方法,對大鼠腦的代謝網絡作圖,并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區的病理過程解析。這篇文章證實了空間代謝組學技術在神經學發展、行為與認知、精神與退行性疾病以及腦**研究領域的廣泛應用前景。大腦的結構極為復雜,且主要功能區域的調節機制與小分子代謝物密切相關。基于色譜-質譜聯用的傳統代謝組學方法無法滿足大腦復雜微區代謝物的定性、定量和定位表征的需求。空間代謝組學找出其代謝物的差異,提供定量檢測。

空間代謝組學:利用基質進行空間成像——MALDI質譜分子成像技術MALDI-MSI分析中非常關鍵的一點是需要添加基質來吸收激光能量,實現被測物的離子化,主要對脂質類化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達到數個微米。其中,MALDI和DESI成像技術目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術。這兩種技術與質譜相連,使用范圍有一定的互補性。二者結合使用,可實現“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點呢?空間代謝組特異性強等優點。安徽空間代謝組學價格

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以上結果表明,AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產物,并具有高特異性,能呈現其在大腦微區分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區代謝網絡圖要了解大腦的結構區域發生的復雜代謝過程,不僅應準確表征代謝物,還要研究其相關性。從大鼠腦微區中提取代謝譜進行代謝網絡重建。從15個微區提取的MSI數據進行峰挑選和峰對齊(圖1F),包括松果體、中腦導水管、腦橋、梨狀皮質、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。河北空間代謝組學公司

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