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黑龍江質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-10

空間代謝組學(xué):質(zhì)譜成像技術(shù)近二十年來(lái),隨著質(zhì)譜離子化技術(shù)的不斷發(fā)展,質(zhì)譜成像技術(shù)因其能夠直觀、快速、簡(jiǎn)便地呈現(xiàn)出分子在細(xì)胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時(shí)間分布等信息,越來(lái)越受到大家的關(guān)注。并且質(zhì)譜成像技術(shù)也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領(lǐng)域的高質(zhì)量文章中,為生物標(biāo)志物的高靈敏度探測(cè)和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎(chǔ),下面進(jìn)入到質(zhì)譜“畫(huà)”時(shí)代~是什么?有多少?在哪里?回答以上“靈魂”3問(wèn),首先需要了解他們之間的關(guān)系。質(zhì)譜是通過(guò)采集化合物的質(zhì)荷比,獲得定性和定量的信息,進(jìn)而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么?”和“有多少?”這兩個(gè)根本性問(wèn)題。空間代謝組分析測(cè)序服務(wù)。黑龍江質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)

空間代謝組的成像。生成空間代謝組譜圖和拉曼相關(guān)圖,從而能夠?qū)⒄駝?dòng)光譜檢測(cè)到的結(jié)構(gòu)特征分配給通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)到的單個(gè)分子物種(圖3D,E)。一般說(shuō)來(lái),數(shù)據(jù)顯示了與多種不同脂質(zhì)相關(guān)的拉曼振動(dòng)峰之間的高度相關(guān)性。由于可以獲得很好的相關(guān)性,作者隨后對(duì)拉曼光譜和質(zhì)譜進(jìn)行了PLS多元回歸。用作為例子,作者回歸了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光譜。回歸載體顯示高度特異的脂峰,表明對(duì)磷脂酰膽堿具有特異性(圖3F)。回歸分析表明,可建立高度線性關(guān)系(校正R2=0.825)(圖3G)。假設(shè)在一級(jí)近似下質(zhì)譜與濃度的線性關(guān)系,這個(gè)基于拉曼的模型可以作為復(fù)雜組織中特定脂質(zhì)種類的預(yù)測(cè)因子。這些結(jié)果**了使用基于結(jié)構(gòu)和生物分子信息的互補(bǔ)光譜模式的脂肪組譜的新證明。湖北空間代謝組學(xué)和心臟空間代謝組學(xué)-靶向代謝組學(xué)服務(wù)-擅長(zhǎng)多組學(xué)聯(lián)合分析。

1.樣本準(zhǔn)備Sprague-Dawley大鼠模型腹腔注射東莨菪堿后被殺死(處理組,3只),對(duì)照組大鼠(3只)也用同樣方法殺死。獲取大鼠整個(gè)大腦,在低溫下將大腦切成連續(xù)的矢狀切片(暴露出海馬和紋狀體),用于Nissl染色、H&E染色和質(zhì)譜成像檢測(cè)。2.空間代謝組實(shí)驗(yàn)使用AFADESI-MSI分析,代謝物質(zhì)量數(shù)范圍50-500Da,質(zhì)譜分辨率70,000。3.數(shù)據(jù)處理和代謝網(wǎng)絡(luò)分析原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)化,再使用自建MassImager軟件獲取成像結(jié)果;在獲取差異代謝物的高分辨率質(zhì)譜信息后,使用Metaboanalys在線數(shù)據(jù)挖掘軟件以褐家鼠(rattusnorvegicus)為參考完成代謝物高通量定性,并輸出代謝網(wǎng)絡(luò)信息。大腦中復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化使用Cyctoscope軟件完成。

質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對(duì)于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無(wú)需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢(shì)。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能。本篇小鹿盤(pán)點(diǎn)5篇空間代謝組學(xué)在科學(xué)研究中的經(jīng)典應(yīng)用~給您的組學(xué)研究提供更多支持~空間代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)。

空間代謝組學(xué):該技術(shù)解決了生物組織中低含量代謝物難檢測(cè)、覆蓋種類少和成像質(zhì)量差等技術(shù)難題,可實(shí)現(xiàn)生物組織中約1500個(gè)代謝物的成像分析,包括膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類和脂質(zhì)類等,并精確表征與識(shí)別功能代謝物在組織亞區(qū)域的分布特征。在獲得AFADESI-MSI平臺(tái)原創(chuàng)團(tuán)隊(duì)全力支持下,經(jīng)過(guò)前期的研發(fā)以及1年時(shí)間的技術(shù)服務(wù)積累,鹿明生物已經(jīng)完成了心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等二十幾種臨床/動(dòng)物/植物組織樣本的空間代謝組學(xué)檢測(cè)及分析,積累了豐富的樣本前處理經(jīng)驗(yàn)。空間分辨代謝組學(xué)進(jìn)展和挑戰(zhàn)。浙江空間代謝組學(xué)是什么

空間代謝組學(xué)是廣大客戶的選擇,認(rèn)準(zhǔn)鹿明生物。黑龍江質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)

再帕爾·阿不力孜、賀玖明研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用空間代謝組學(xué)繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò)圖。2021年4月,中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室再帕爾·阿不力孜、賀玖明團(tuán)隊(duì)在分析化學(xué)一區(qū)《Analytical Chemistry》期刊發(fā)表封面文章,題為“Mapping metabolic networks in the brain by using ambient mass spectrometry imaging and metabolomics”的研究成果,通過(guò)空間代謝組學(xué)技術(shù),***揭示了大鼠腦代謝網(wǎng)絡(luò),深入解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化。黑龍江質(zhì)譜成像空間代謝組學(xué)

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