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北京代謝組學書籍

來源: 發布時間:2023-07-19

非靶向GC-MS代謝組學、LC-MS代謝組學研究標題:中國濃香白酒生產過程中人工窖泥中原核生物群落的結構和功能變化研究對象:濃香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影響因子:6.469發表時間:2020年3月合作單位:四川省農業科學院水稻高粱研究所運用歐易/鹿明生物技術:TMT標記定量蛋白質組學、PRM靶向驗證、非靶向GC-MS代謝組學、LC-MS代謝組學、16SrRNA測序,本篇非靶向代謝組學分析共鑒定出7,478種代謝物。GC-MS代謝組學和LC-MS代謝組學方法在OP***A中均可明確分離批次(圖5a至d)。在第四批人工窖泥樣品中,分別上調和下調了491和523種代謝物。差異代謝產物被分為16個功能類別(圖5f)。脂質和類脂質分子(38.07%)**多,其次是有機雜環化合物(16.17%)和有機酸及其衍生物(13.11%)。代謝組學 生物標志物挖掘**-歐易生物。北京代謝組學書籍

非靶代謝組學研究:2022年03月,歐易/鹿明生物合作客戶重慶醫科大學附屬第二醫院消化內科周智航團隊在International Journal of Biological Sciences期刊發表的題為 “Enhanced pentose phosphate pathway activity promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression via activating YAP/MMP1 axis under chronic acidosis”的研究成果,通過采用非靶代謝組學和基因表達芯片,發現了適應酸性微環境的胰腺導管腺* (PDAC)細胞具有更強的轉移和增殖能力。


代謝組學顯示適應酸性微環境的 PDAC 細胞中葡萄糖增加、糖酵解減少,而轉錄組學發現適應酸性微環境細胞中的差異表達基因主要為細胞外基質修飾和 Hippo 信號傳導相關基因。MMP1 在在適應酸性微環境細胞中上調**為明顯,實驗驗證了其由 YAP/TAZ 通路介導,而被 AMPK抑制。該研究確認了代謝重編程通過AMPK/ YAP /MMP1軸促進適應酸性微環境的 PDAC 細胞的增殖和轉移。 上海微生物代謝組學代謝組學熱圖聚類分析 火山圖 散點圖如何繪制。

雙平臺代謝組學研究,2022年02月,中國中醫科學院廣安門醫院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,發現了***通絡方可有效地防治糖尿病并發癥形成與發展,探究了***通絡方防治糖尿病視網膜病變的作用機制,***通絡方可改善糖尿病大鼠視網膜組織病理損害;提高視網膜緊密連接蛋白,保護血-視網膜屏障;抑制p38MAPK相關通路及IncRNA MALAT1水平;降低全身及局部視網膜的炎癥及氧化應激水平。為***通絡方防治糖尿病視網膜病變提供了實驗依據。LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學主要用于***的中藥成分分析。

代謝組學”的主流研究工具有:GC-MS(氣相色譜)GC-MS是代謝組學研究的經典技術,具有技術成熟穩定、靈敏度高等特點,同時,由于具有相對完善的數據庫,使得定性也更為準確可靠,缺點則主要表現在樣品處理相對復雜,對于不易衍生化的物質定性和定量較困難。LC-MS(液相色譜)優勢主要表現在樣品制備和前處理簡單、實驗重復性好,靈敏度高,分離和分析范圍廣,缺點則主要表現在數據庫完善程度不夠,定性相對困難。NMR(核磁共振)比較大的優勢是對樣品無破壞性,測定無偏向性,即適用于血液、尿液體液等液體樣品,也適用于組織和***等固體樣品,并且測定速度快,可實現樣品代謝組的動態監測,缺點是靈敏度低。代謝組學生物解析 非靶代謝組學研究 靶向代謝組學研究。

LC-MS非靶向代謝技術發現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響。標題:藻酸鹽寡糖化小鼠的微生物群成功減輕了小腸粘膜炎期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠小腸、腸道內容物、血漿*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組、轉錄組、16S微生物多樣性檢測等本研究發現藻酸鹽寡糖(AOS)可以減輕***藥物白消安誘導的小腸細胞膜的損傷,特別是細胞連接和微絨毛;并有利于腸道菌群變化進而改善小腸功能,提高腸道的免疫功能。LC-MS非靶向代謝技術發現了糞便移植(FMT)對血液代謝的影響,并分析了血液代謝物與腸道菌群之間的相關性,發現不同劑量的糞便移植對血液代謝組均產生了***影響,其中大部分是在小腸功能中起著重要作用的脂質代謝物,表明FMT可以在血液中恢復被白消安擾亂的代謝物。相關性分析表明,“有益菌”乳酸桿菌有助于血液代謝產物的恢復,“有害菌群”則不能協助血液代謝物的回收,揭示了FMT可改善小腸功能和腸道菌群,恢復血液代謝的原因。代謝組學,代謝組數據庫,代謝組分析,基因檢測。浙江代謝組學特征

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藏茶是具有地域特征的民族產品,也是一種傳承中國傳統的傳統飲料。該研究對四種藏茶的代謝特性和生物活性進行了評價。鑒定出83種非揮發性代謝產物,包括氨基酸及其衍生物、酚酸、黃酮類化合物、核苷酸及其衍生物、萜類、生物堿、有機酸、脂類等。川茶和131富含萜類和脂類物質。梅占中氨基酸及其衍生物、酚酸和黃酮類化合物含量比較高。26種關鍵揮發性化合物被認為具有氣味活性。梅占表現出比較高水平的抗氧化和低血糖活性。統計學分析表明,多酚類、黃酮類和兒茶素與生物活性呈***相關(|r|≥0.7, P<0.05)。該研究表明,不同品種藏茶的代謝譜存在明顯差異,為藏茶品質檢測提供了清晰的數據基礎。北京代謝組學書籍

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