有哪些技術手段可以進行空間轉錄組研究？已發表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細胞數量上限制較大，或是存在有效測序深度不足等問題。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前較好的一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。研究通過對 ALS 小鼠疾病進程（癥狀前、發病、癥狀期和終末期）的脊髓組織進行空間轉錄組測序。吉林歐易生物空間轉錄組規格

10xVisium空間轉錄組技術原理為將新鮮冷凍的組織切片，置于文庫制備載玻片上，經過固定、染色和透化后，釋放出mRNA，mRNA與空間條形碼捕獲探針相結合，從而捕獲基因表達信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測序文庫進行測序，并對數據進行可視化分析。空間轉錄組技術作為當今**前沿的科研技術，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。天津空間轉錄組報價對于 EDA 以外的任務，用戶仍然經常需要學習新的語法，轉換對象類型，空間轉錄組學仍然面臨許多挑戰。

空間基因表達技術能夠在保留空間背景信息的同時，多方位測量轉錄組譜。然而，現有的分析方法并沒有解決技術分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉錄組數據的分辨率并進行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數據結構將預處理數據作為輸入，無縫集成到空間轉錄組分析工作流中，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中，該對象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

高通量空間轉錄組學數據的處理和分析需要新穎的方法和工具支撐，尤其是在預處理、scRNA-seq 數據的空間重構、基于微陣列數據的細胞類型去卷積、空間高變基因的識別、細胞間相互作用的推導等。scRNA-seq 技術的進步啟發了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數據的互補性質的新方法。對于未進行轉錄組測序的 smFISH 和 ISS 數據，可通過 scRNA-seq 數據估算空間數據中未分析的基因的表達模式。此外，“空間轉錄組學”這一術語的變體，也用于描述將轉錄本定位到細胞器的技術（例如 APEX-seq），盡管該技術沒有記錄任何空間坐標。只聽名字就想嘗試，不清楚空間轉錄組的原理及通過該技術究竟能拿到什么結果。

美國腦計劃啟動的 BICCN 項目，該項目將整合不同類型細胞的分子、解剖學和生理學特性，創建小鼠腦細胞 3D 參考圖譜，同時也將基于人類和非人類靈長類腦組織樣本，繪制腦細胞參考圖譜 ，其涉及空間轉錄組學技術主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些實現空間轉錄組學的重要技術，可以追溯到二十世紀七十年代，長期以來，各種形式的原位雜交技術（ISH）已用于可視化空間中的基因表達。從技術原理中不難看出，空間轉錄組技術重要為特殊的載玻片。空間轉錄組可以進行細胞間通訊分析，區別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。海南歐易生物空間轉錄組規格

空間轉錄組樣本的組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列。吉林歐易生物空間轉錄組規格

1. 10x  Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域，每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。10X Visium空間轉錄組的實驗主要分為兩部分：組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態學信息；組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息 。吉林歐易生物空間轉錄組規格

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