人類細胞圖譜項目的主要目標之一是描述所有細胞類型的空間關系。同時基于表達特征對多種細胞類型進行空間映射，有助于研究不同細胞類型之間的相互作用。已經發(fā)展了一些策略來檢測單細胞分辨率的空間基因表達譜，如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。為了更有效地為研究群體探索空間基因表達數(shù)據(jù)，我們構建了SpatialDB數(shù)據(jù)庫用于空間解析的轉錄組。

人類細胞圖譜項目極大地推動了單細胞水平的生命科學研究。空間轉錄組學技術的發(fā)展和空間基因表達數(shù)據(jù)的快速積累是未來的發(fā)展趨勢。我們將繼續(xù)收集新的技術和數(shù)據(jù)集來更新SpatialDB。此外，我們將整合更多的工具和數(shù)據(jù)源來分析數(shù)據(jù). 10x? Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm。吉林歐易生物空間轉錄組使用

空間轉錄組技術作為當今前沿的科研技術，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司（以下簡稱“歐易生物”）主辦的“空間轉錄組學培訓班”落下帷幕。培訓中，歐易講師團隊以其豐富的項目經驗及專業(yè)的生信能力，從空間轉錄組學的發(fā)展歷程、測序原理、實驗實操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度，向遠道而來的學員們展開了系統(tǒng)性的培訓。

陜西宣傳空間轉錄組轉錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉錄本來獲取，?如空間轉錄組技術。

空間轉錄組的一般流程。將準備好的新鮮冷凍組織切片放置于空間轉錄組芯片上。每個細胞中的RNA分子都包含著基因表達的信息。組織切片成像，以檢索組織學信息。這樣就可以看到一個細胞或一組細胞在組織中的位置。空間轉錄組芯片上含有上千個捕獲的spot，這些捕獲探針的 Poly-T 尾可以結合RNA分子的 Poly-A 尾。這些陣列的排列順序就像一個棋盤，帶有相同身份條形碼（barcode）的探測位于同一個正方形中。這樣就可以確定每個捕獲探針及其結合RNA的來源。組織切片固定。該芯片包含一個與組織切片一起成像的視覺可檢測框架。

10xVisium空間轉錄組技術原理為將新鮮冷凍的組織切片，置于文庫制備載玻片上，經過固定、染色和透化后，釋放出mRNA，mRNA與空間條形碼捕獲探針相結合，從而捕獲基因表達信息。然后將捕獲的mRNA合成cDNA并制備測序文庫進行測序，并對數(shù)據(jù)進行可視化分析。空間轉錄組技術作為當今**前沿的科研技術，相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中，快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。Science發(fā)表了將組織擴展和原位RNA測序結合起來的新型空間轉錄組技術ExSeq。

Visium空間轉錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么？10X Genomics測試過很多組織類型，絕大多數(shù)都可以用于空間轉錄組的分析。下圖是他們官網上測試過的組織類型的列表，測試過的組織都可以運用在空間轉錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達玻片做正式實驗前，務必用組織優(yōu)化的玻片測試一下，看組織能否用于空間轉錄組的實驗，同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主，但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。對于 EDA 以外的任務，用戶仍然經常需要學習新的語法，轉換對象類型，空間轉錄組學仍然面臨許多挑戰(zhàn)。廣西空間轉錄組領域

該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉錄組學數(shù)據(jù)的整合和分析。吉林歐易生物空間轉錄組使用

10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎？下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果，從10x Genomics空間轉錄組分析結果中，可以清晰看到Tmsb4x（B圖）和Selenow（C圖）在海馬體區(qū)域高表達，和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備？空間轉錄組是一項十分前沿的技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗。吉林歐易生物空間轉錄組使用

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司專注技術創(chuàng)新和產品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大。公司目前擁有專業(yè)的技術員工，為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間，為客戶提供高質的產品服務，深受員工與客戶好評。誠實、守信是對企業(yè)的經營要求，也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務，我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發(fā)展做正確的事情，將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經過幾年的發(fā)展，已成為科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢行業(yè)出名企業(yè)。