歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序，在樣本包埋、切片、實驗和數據分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計，分享歐易生物在樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象：A、對空間轉錄組感興趣，期望了解空間轉錄組技術，或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展，需要深入挖掘數據的科研工作者。空間轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失。遼寧歐易生物空間轉錄組做什么

1. 10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前可選的一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組是一項前沿技術，涉及到很多細節方面的準備工作，例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素，處理不慎容易導致整個項目失敗。遼寧空間轉錄組質量10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉錄組測序技術。

空間基因表達技術能夠在保留空間背景信息的同時，多方位測量轉錄組譜。然而，現有的分析方法并沒有解決技術分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉錄組數據的分辨率并進行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數據結構將預處理數據作為輸入，無縫集成到空間轉錄組分析工作流中，輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中，該對象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

空間轉錄組的一般流程。將準備好的新鮮冷凍組織切片放置于空間轉錄組芯片上。每個細胞中的RNA分子都包含著基因表達的信息。組織切片成像，以檢索組織學信息。這樣就可以看到一個細胞或一組細胞在組織中的位置。空間轉錄組芯片上含有上千個捕獲的spot，這些捕獲探針的 Poly-T 尾可以結合RNA分子的 Poly-A 尾。這些陣列的排列順序就像一個棋盤，帶有相同身份條形碼（barcode）的探測位于同一個正方形中。這樣就可以確定每個捕獲探針及其結合RNA的來源。組織切片固定。該芯片包含一個與組織切片一起成像的視覺可檢測框架。空間轉錄組可以進行細胞間通訊分析，區別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。

10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達解決方案是目前***一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案巧妙的將單細胞測序技術原理和組織切片染色結合在一起，從而研究空間分辨率下整個轉錄組 mRNA 的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類：機械和光學。前者包括 Tomo-seq 等，通過沿感興趣軸，利用冷凍切片機進行組織切片，然后在每個切片上均進行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種：用于摸索組織比較好透化時間的組織優化玻片和用于正式實驗的基因表達玻片。空間轉錄組測序技術在進行 HE 染色的同時需要保證獲取組織基因表達信息。什么是空間轉錄組使用

Cell上發表了一篇利用空間轉錄組解析人鱗狀細胞*的文章。遼寧歐易生物空間轉錄組做什么

 **近，空間轉錄組學研究炙手可熱。細胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關系對于理解疾病病理可能至關重要。空間轉錄組學是一項開創性的技術，它使科學家能夠測量組織樣本中的所有基因活性，并繪制出發生該活性的位置的圖。該技術已經導致了新發現，這些新發現將有助于幫助科學家更好地了解生物過程和疾病。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于**、免疫、發育、神經和病理等研究方向。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。遼寧歐易生物空間轉錄組做什么

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