空間重構的計算策略：這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉錄組數(shù)據(jù)中重構細胞間的環(huán)境。然而，這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局?；贚CM的方法：基于LCM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組，盡管其通量很低，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構成***的巨大背景中，可能具有一定價值。基于圖像的原位轉錄組學：基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區(qū)域，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞?？臻g條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。盡管當前空間轉錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長，但尚未有對應的數(shù)據(jù)庫來對這些數(shù)據(jù)進行匯總集成。湖南運用空間轉錄組

歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序，在樣本包埋、切片、實驗和數(shù)據(jù)分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計，分享歐易生物在樣本處理、實驗和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經驗，助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象：A、對空間轉錄組感興趣，期望了解空間轉錄組技術，或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展，需要深入挖掘數(shù)據(jù)的科研工作者。歐易生物空間轉錄組價格許多當前時代空間轉錄組技術的基礎都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。

和單細胞轉錄組一樣，空間轉錄組也可以進行細胞間通訊分析，區(qū)別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。通常通過了解配體受體（LR）對并測試 LR 對是否更有可能在鄰近細胞或 spot 中表達來完成。還有很多其他類型的分析可用于空間轉錄組學數(shù)據(jù)，包括基因模式的識別，空間區(qū)域的轉錄組定義， 基因間的相互作用推斷，轉錄本的亞細胞定位以及基于H＆E圖像的基因表達估算等。1. 歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。

1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術，從而解析單個組織切片中的所有mRNA。空間條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序，均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息，為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發(fā)育、神經和病理等研究方向。獲取空間轉錄組中各個spot的細胞類型注釋信息。

有哪些技術手段可以進行空間轉錄組研究？已發(fā)表的關于空間轉錄組技術有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細胞數(shù)量上限制較大，或是存在有效測序深度不足等問題。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前較好的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中，從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。scRNA-seq 技術的進步啟發(fā)了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數(shù)據(jù)的互補性質的新方法。廣東品質空間轉錄組

了解R語言基礎語法及數(shù)據(jù)類型，了解空間轉錄組數(shù)據(jù)分析整體流程。湖南運用空間轉錄組

1. 10x  Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。10X Visium空間轉錄組的實驗主要分為兩部分：組織學板塊和組學板塊。組織學板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像，記錄切片的形態(tài)學信息；組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息 。湖南運用空間轉錄組

上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司位于聯(lián)航路1188號25幢，是一家專業(yè)的檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。公司。在歐易生物近多年發(fā)展歷史，公司旗下現(xiàn)有品牌歐易生物等。公司不僅*提供專業(yè)的檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。，同時還建立了完善的售后服務體系，為客戶提供良好的產品和服務。歐易生物始終以質量為發(fā)展，把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動力，致力于為顧客帶來***的科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。