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山西歐易生物空間轉錄組質量

來源: 發布時間:2021-12-06

空間轉錄組研究的的必要性。研究單細胞我們想要探究細胞間的異質性,但是常規的單細胞是將細胞解離成單細胞懸液,然后利用單細胞分離技術(微孔,微板,液滴)等方法實現單細胞建庫,這里比較大的問題是是細胞失去了原本在組織的空間信息。然而這個空間信息在實際研究中有很重要。特別是在研究細胞命運機制及細胞譜系發生空間位置的信息顯得尤為重要,因此發展空間轉錄組技術實現細胞的位置信息的保留,對研究此類細胞狀態尤為必要。空間轉錄組學技術主要包括 MERFISH 和 seqFISH。山西歐易生物空間轉錄組質量

許多當前時代空間轉錄組技術的基礎都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。例如,于1976 年首先使用紫外線激光來切割組織。當前流行的技術,例如空間轉錄組學(ST)和 10X Visium 依靠這種微陣列技術,區別就在于是從放置在微陣列載玻片上的組織上而不是從溶液中來捕獲轉錄本信息。當前時代的空間轉錄組技術大致分為五類方向:激光顯微切割(LCM),單分子熒光原位雜交(smFISH),靶向原位測序(ISS),原位陣列捕獲和 其他非成像技術。河北空間轉錄組使用轉錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉錄本來獲取,?如空間轉錄組技術。

空間轉錄組(Spatial Transcriptomics)就是將基因的表達情況與關注的組織切片的免疫化學染色圖像進行整合,從而將組織內不同細胞的基因表達信息定位到組織的原始空間位置上去,進而直接觀測組織中不同部位功能區基因表達的差異。空間轉錄組技術利用了常規的原位技術和組學技術兩方面的優勢。目前已發表的關于空間轉錄組技術有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物種有人、小鼠、果蠅、秀麗隱桿線蟲、斑馬魚、擬南芥、楊樹和云杉等。

歐易生物自引進10x Visium空間轉錄組以來已經完成了上百例樣本測序,在樣本包埋、切片、實驗和數據分析上積累了大量寶貴的經驗。本次培訓班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉錄組的研究熱點和方案設計,分享歐易生物在樣本處理、實驗和數據挖掘上的成功經驗,助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象:A、對空間轉錄組感興趣,期望了解空間轉錄組技術,或近期準備開展空間轉錄組測序項目B、項目已經開展,需要深入挖掘數據的科研工作者。空間轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類:機械和光學。

10x  Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區域,每個捕獲區域的大小為6.5x6.5mm,包含5000個被條形碼標記的點(barcoded spots),每個點的直徑為55 μm,點和點之間中心的距離為100 μm,并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA,遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列,然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析,以確定哪些數據來自哪個位置,從而實現空間基因表達的可視化。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗,致力通過高效的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。該類工具的開發將簡化不同類型空間轉錄組學數據的整合和分析。河南空間轉錄組領域

有很多其他類型的分析可用于空間轉錄組學數據,包括基因模式的識別,空間區域的轉錄組定義等。山西歐易生物空間轉錄組質量

10x Genomics空間轉錄組技術的準確性高嗎?下圖是一個將10x Genomics空間轉錄組技術應用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結果,從10x Genomics空間轉錄組分析結果中,可以清晰看到Tmsb4x(B圖)和Selenow(C圖)在海馬體區域高表達,和已知的研究結果一致性較高。開展10x Genomics空間轉錄組需要做哪些準備?空間轉錄組是一項十分前沿的技術,涉及到很多細節方面的準備工作,例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導致整個項目失敗。山西歐易生物空間轉錄組質量

上海歐易生物醫學科技有限公司坐落在聯航路1188號25幢,是一家專業的檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫藥產品、生化產品的研發,醫藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監控化學品、易制毒化學品)的研發、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業管理咨詢。公司。公司目前擁有較多的高技術人才,以不斷增強企業重點競爭力,加快企業技術創新,實現穩健生產經營。誠實、守信是對企業的經營要求,也是我們做人的基本準則。公司致力于打造***的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢。公司憑著雄厚的技術力量、飽滿的工作態度、扎實的工作作風、良好的職業道德,樹立了良好的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢形象,贏得了社會各界的信任和認可。

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