歐易生物高級技術支持陳老師首先給大家介紹了空間轉錄組學的發展歷程、測序流程及原理。緊接著，歐易生物技術支持姚老師針對目前空間轉錄組學發表的一系列高分文章進行了方案設計的解析。姜老師給大家詳細介紹了空間轉錄組項目樣本準備、切片、貼片等實驗過程及注意事項，并帶領大家到實驗室實地觀摩了整個實驗過程，并就其中細節進行了講解。董老師針對空間轉錄組10x Space Ranger的分析原理及結果進行了詳細解析，并介紹了使用Seurat包進行數據挖掘的標準分析流程。空間轉錄組樣本的組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列。天津歐易生物空間轉錄組做什么

空間基因表達技術能夠在保留空間背景信息的同時，多角度測量轉錄組譜。然而，現有的分析方法并沒有解決技術分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團隊開發了BayesSpace，這是一種完全貝葉斯統計方法，它使用來自空間鄰域的信息來增強空間轉錄組數據的分辨率并進行聚類分析。基準測試證明BayesSpace在識別具有相似表達譜的空間簇和提高空間轉錄組學分辨率方面的效用，其既克服了有效利用空間信息進行表達數據聚類的挑戰，又克服了目前空間轉錄組技術分辨率有限的問題。廣西空間轉錄組報價Cell上發表了一篇利用空間轉錄組解析人鱗狀細胞*的文章。

本文利用空間轉錄組學研究了在AD小鼠模型中，淀粉樣斑塊周圍直徑為100mm的組織域中發生的轉錄變化。發現了富含髓鞘和少突膠質細胞基因（OLIGs）的基因共表達網絡的早期改變，而斑塊誘導的基因（PIGs）的多細胞基因共表達網絡涉及補體系統、氧化應激、溶酶體和炎癥，在疾病的后期非常突出。此外作者通過對小鼠和人腦切片進行原位測序（ISS），證實了大多數觀察到的細胞水平的變化。空間轉錄組學分析為探究AD和其他腦部疾病致病特征附近失調的細胞網絡提供了可能。

10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達解決方案是目前***一個高通量空間轉錄組的商業化解決方案。該解決方案巧妙的將單細胞測序技術原理和組織切片染色結合在一起，從而研究空間分辨率下整個轉錄組 mRNA 的表達情況，同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息。空間轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類：機械和光學。前者包括 Tomo-seq 等，通過沿感興趣軸，利用冷凍切片機進行組織切片，然后在每個切片上均進行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種：用于摸索組織比較好透化時間的組織優化玻片和用于正式實驗的基因表達玻片。在未來的5-10年里，空間轉錄組學妥妥的是技術熱點。

和單細胞轉錄組一樣，空間轉錄組也可以進行細胞間通訊分析，區別在于空間位置信息可以同時用于識別潛在的細胞間相互作用。通常通過了解配體受體（LR）對并測試 LR 對是否更有可能在鄰近細胞或 spot 中表達來完成。還有很多其他類型的分析可用于空間轉錄組學數據，包括基因模式的識別，空間區域的轉錄組定義， 基因間的相互作用推斷，轉錄本的亞細胞定位以及基于H＆E圖像的基因表達估算等。1. 歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。盡管當前空間轉錄組的數據在快速地增長，但尚未有對應的數據庫來對這些數據進行匯總集成。運用空間轉錄組規格

10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉錄組測序技術。天津歐易生物空間轉錄組做什么

空間轉錄組的方法和技術有哪些？廣義上講，現有的生成空間分辨轉錄組學的方法可分為四類：用于空間重建的計算策略和組學實驗的組合，使用激光捕獲顯微切割（LCM）結合高通量進行直接測量，使用熒光物質的基于圖像的原位轉錄組學 ，以及基于寡核苷酸的空間條形碼再加上高通量。每種方法都有其優點和缺點。空間重構的計算策略：這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢，從單個細胞的大量轉錄組數據中重構細胞間的環境。然而，這些推論方法在某些情況下*呈現空間趨勢或特定組織的總體布局。基于LCM的方法：基于LCM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組，盡管其通量很低，但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前，將少量細胞的數據粗略地整合到構成***的巨大背景中，可能具有一定價值。基于圖像的原位轉錄組學：基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區域，但也存在一些問題，例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞。空間條形碼加高通量：費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。天津歐易生物空間轉錄組做什么

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