免疫組庫是功能相似的n多細胞的統稱。而“免疫”是指免疫細胞,特指T/B淋巴細胞。“So~免疫組庫”(Immune Repertoire,IR),指某個體,特定時間點下,所有功能多樣性T/B淋巴細胞的總和。T/B細胞利用細胞表面受體(TCR/BCR)識別和結合抗原,介導機體產生針對性的免疫應答,發揮免疫功能并做好記錄備案,如果該抗原再次入侵可迅速作出反應,作為健康衛士守護肌體城池。基因片段V(D)J (Variable-可變區; Diversity-多樣區; joining-連接區;) 會發生隨機重組,各基因片段可變形式分別為,V區(52種),D區(2種),J區(13種),配合V(D)J片段中堿基的插入和缺失,進一步相互間的排列組合存在1012種以上組合形式,以此構成了TCR和BCR多樣性的來源,而這種多樣性正是適應性免疫系統能夠識別眾多抗原的基礎。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。溫州單細胞BCR測序
免疫組庫測序有必要做嗎? 對于十的十二次方個以上的抗原識別基數來說,群體和個體間的免疫組庫的豐富程度能夠直接反應機體免疫系統情況,通常TCR/BCR的亞型越多,機體識別病原的能力越強,越不容易患病,但超過一定限度,也容易引發自身免疫性疾病。且機體的免疫組庫也不是一成不變的,會隨著年齡,環境,藥物,患病等等因素,免疫組庫多樣性也時刻處于動態變化當中。由此,將免疫組庫測序用于臨床診斷和診療上,有助于對群體或個體間進行免疫監測,探究相關疾病和免疫應答的關系,監測免疫療法的效果,研究疾病發生、發展的分子機制。常州單細胞多組學測序價格烈冰專精單細胞多組學測序領域。
單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態,在異質性發育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。
空間轉錄組測序與單細胞測序的結果不同,這里存在一個概念叫做Number of Spots under tissue,即,空間轉錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候,貼片的質量就成為了制約空間轉錄組有效區域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉片上,那么容易出現雖然有HE染色有組織片子,但是沒有基因表達,即無有效Spot位點。同樣的,另一個就是組織切片的大小,也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小,分析的有效區域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉錄組分析結果的基礎質量。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。
烈冰生物生信分析團隊緊追國際前沿、整合添加多項國際期刊認可的空轉分析工具,構建一套完整的數據分析流程;精心研發空轉結果瀏覽器,可同步展示空間轉錄組與單細胞測序分析結果,詳細深入地解析空間轉錄組數據。完成從Raw data(原始數據)到Spot-Gene的具有定位信息的表達矩陣的過程后,就進入了空轉的第二步,去進行Spot的Cluster的過程,熟悉單細胞測序的研究者知道,Cluster在單細胞測序中往往表示為細胞的類型,也就是說能聚在一起采用算法分為一個群體細胞是一個Celltype(當然分情況也會有不同)。而在空轉中,也正是由于前面提到了細胞的非單一性,導致了這里的分群并不是單純的同一細胞類型,而應該認為是具有相同細胞組成的點陣區域,或者說是近似的組織結構區域。經驗豐富的實驗團隊,為獲得示組織內真實表達水平的高質量冷凍切片提供硬件和技術保障。杭州BD VDJ測序價格
烈冰智造PanoCell單細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。溫州單細胞BCR測序
10X Genomics和Drop-Seq的技術原理。是利用十字交叉的通道,從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術,將之輸入到油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫,進而完成細胞中RNA的捕獲過程。溫州單細胞BCR測序
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