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二代測序單細胞測序多組學測序

來源: 發布時間:2022-06-12

單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程,還幫助科學家在健康和疾病研究的關鍵領域取得新進展。那些過去從轉錄平均值或單項參數讀取中無法獲得的新發現正在改變我們對傳染病、神經退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態,到揭開疾病用藥應答和耐藥的潛在機制,單細胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學和醫療。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統,曾經模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數,而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。二代測序單細胞測序多組學測序

作為單細胞測序的一個重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平臺整合了儀器、試劑盒和信息學軟件,能精確對接illumina測序儀,因此可實現大量大細胞的快速高效標記、測序和分析,獲得單細胞水平的基因表達譜和差異情況,并通過對復雜細胞群體進行深入細致分析,繪制大規模單細胞表達圖譜。 以量化細胞內的群體異質性,并逐個鑒定細胞類型、細胞狀態和動態細胞躍遷。除了有望鑒定新的細胞亞型和稀有細胞群體,單細胞技術還能更好地了解轉錄動態和基因調控關系。天津二代測序單細胞測序多組學測序十二年測序經驗,烈冰生物單細胞多組學領域的佼佼者。

為什么需要單細胞分辨率? 生物學就像宇宙一樣。它非常復雜,有許多獨特的單體,也就是細胞。這些細胞相互作用并扮演不同的角色,在更大的體系中構建并驅動多個過程。就像伽利略探索宇宙的努力一樣,發現和定義這些細胞也需要高分辨率的工具,才能解開促成生物學復雜性的基因表達異質性。單細胞測序能夠在以一個細胞為功能單位中開展生物學研究,闡明具體細節,構建出一幅更大、更精細的圖譜,說明導致產生某種外在表型的不同類型的分子和細胞之間是如何相互作用的:患者為什么會復發?是什么讓這種疫苗能夠有效防止傳染等等諸多問題。

基因和基因產物并不是單獨運作的,而是參與了相互關聯的復雜通路、網絡和分子系統,這些合在一起實現了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統如何運作至關重要。”為了推動科學發現,科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細胞RNA測序和單細胞多組學——即在單細胞分辨率下對基因表達及其他基于DNA、RNA或蛋白質的分析物進行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學問題上已證實是行之有效的。高通量測序技術是對傳統測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。

關于單細胞測序實驗樣本制備,這與流式細胞術用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數和質量控制步驟,以確保您的樣本有適當濃度的活細胞,并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進行染色,標記細胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據您的起始材料和實驗目標而定。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質量、樣本豐度、細胞大小,以及是否需要提取出細胞核進行染色質可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生成高質量的單細胞懸液。烈冰科技成立10余年,為科研學者提供專注的測序數據分析服務。廣州高通量測序單細胞測序商業化服務

基因測序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用,是下一個改變世界的技術。二代測序單細胞測序多組學測序

細胞計數和活力評估在評估樣本質量時,需要在細胞清洗和過濾之后測定細胞活力,這一點至關重要。測定細胞活力有許多種方法,烈冰多年單細胞測序經驗發現臺盼藍法在鑒定活細胞與死細胞的比例時效果很好。細胞計數的準確性以及目標回收量和實際回收量之間的一致性,取決于我們了解樣本中有多少個細胞。一旦過濾和清洗完成,可采用細胞計數設備(如血球計數器或自動細胞計數儀)進行定量。這些設備不但能提供準確的細胞計數,還能計算出向微流體芯片上樣適量細胞所需的細胞懸液體積。二代測序單細胞測序多組學測序

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