科技的發展讓單細胞測序已經應用于疾病發展過程中的關鍵過程和事件，如前病變向惡性的轉化、惡性向轉移性的發展，以及對多種用藥的反應。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞或者細胞核進行測序得到結果的技術，其空間定位信息是丟失的。這就衍生出了一個問題就是如果單細胞A與B并不出現在一個組織區域中他們會互相影響或者轉化么？免疫研究中，兩個具有非常強的PDL1-PD1的配對關系的細胞在組織切片上風馬牛不相及，這樣PDL1-PD1的關系會生效么？烈冰單細胞測序，助力您的深入科學探究。上海高通量測序單細胞測序平臺

一味的追求高細胞數量的捕獲，小心得不償失，原因在這：單細胞測序所有的分析都是基于細胞聚類進行，而細胞聚類是在區分cell和non-cell后，獲得細胞基因表達譜，通過降維（pca），無監督聚類以及可視化（t-SNE）得到的。進行細胞聚類時需要考慮到每個細胞的基因表達模式，因此即使是相同的數據，在剔除幾個細胞的情況下，前后獲得的聚類圖也會出現明顯不同。而當細胞捕獲數過多時，無論是假陰性和假陽性數據還是多細胞數據，都會對正常細胞聚類產生影響，造成聚類結果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個樣本捕獲細胞數在2000-3000的原因了。烈冰建議單個樣本捕獲細胞數在3000-5000個時，數據量在100G左右時，可以滿足分析和文章發表的多重需求。長沙二代測序單細胞測序服務機構十二年測序經驗，累計服務與5000余項重要科研項目。

10× Genomics官方建議，當單細胞懸液活性低于70%時應做去除死細胞操作，并推薦使用MACS? Dead Cell Removal Kit(Miltenyi Biotec)。需要注意到，去除死細胞的操作會損失一定的細胞數量，10× Genomics和Miltenyi Biotec都沒有給出單細胞懸液含有多少細胞數量才建議做去除死細胞的操作。基于烈冰多年單細胞測序實驗經驗，建議當細胞懸液進行質量和活性檢測后，考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液（小于30%），懸液中細胞大量死亡，可能已經丟失了原組織內的細胞比例和狀態，失真嚴重，建議重新收集樣本進行新的實驗，保證數據的高質量和實驗結果的準確性。

高通量測序技術（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術（“Next-generation” sequencing），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。高通量測序技術是對傳統測序一次顛覆性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的 分析成為可能，所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。而烈冰科技具有專業生物背景和十二年科研服務經驗，已助力Nature，immunity等在內的300+篇CNS文章發表。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究逐漸演變到臨床應用，是下一個改變世界的技術。

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數大約在50k左右；每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數普遍較少，導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養的如干細胞等，他們的基因表達數較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此，我們對細胞數量以及基因中位數確認時，需要考察實際組織的細胞組成。烈冰科技成立10余年，為科研學者提供專注的測序數據分析服務。南京10X Genomics單細胞測序服務機構

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烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺，針對龐大的單細胞測序數據，能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準：一鍵導入gene list構建個性化基因列表；輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot；任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型；一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖：輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖，還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板，幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析，節省工作時間并提升整體工作效率。上海高通量測序單細胞測序平臺

上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司，是一家集研發、設計、生產和銷售為一體的專業化公司。烈冰生物作為生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調查（不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗），從事貨物及技術的進出口業務，計算機、軟件及耗材（除專控），軟件開發【依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動】的企業之一，為客戶提供良好的單細胞測序，生物大數據云分析平臺，空間轉錄組測序，單細胞多組學測序。烈冰生物繼續堅定不移地走高質量發展道路，既要實現基本面穩定增長，又要聚焦關鍵領域，實現轉型再突破。烈冰生物始終關注自身，在風云變化的時代，對自身的建設毫不懈怠，高度的專注與執著使烈冰生物在行業的從容而自信。