單細胞RNA-seq、RNA-seq和逆轉錄qPCR（RT-qPCR）都采用一個共同過程，即分離RNA并將其轉化為cDNA進行分析。不過，每種分析在開展方式和獲得的數(shù)據上有所不同。RNA-seq和RT-qPCR都是先從大量細胞中分離RNA，然后將其轉化為cDNA。RNA-seq是使用cDNA來構建新一代測序文庫，從而測定整個轉錄組的基因表達。RT-qPCR則是從cDNA中擴增特定靶點，并通過熒光測定表達水平。RT-qPCR限于已知靶點，而RNA-seq可實現(xiàn)無偏倚的全轉錄組基因表達分析。然而，這兩者只能提供細胞群體內基因表達的平均情況。單細胞RNA-seq則在分離RNA之前將單細胞分離到微孔或單個微反應容器中。然后用細胞特異性的條形碼標記RNA，確保來自每個細胞的cDNA可以追溯到起源細胞。與RNA-seq相似，帶有條形碼的cDNA也被用于構建新一代測序文庫，從而能夠對每個細胞的整個轉錄組進行基因表達測定。烈冰生物成立于2010年，專注于單細胞測序領域科研服務。武漢二代測序單細胞測序百萬通量平臺

機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經歷轉錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉化和變化進行描述。10X Genomics單細胞測序數(shù)據分析培訓班高通量測序技術是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。

細胞中基因的表達是嚴格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉錄組測序來分析。但是單細胞轉錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結構，無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息。而空間轉錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息，在保留組織形態(tài)結構的基礎上，獲得細胞/基因的空間表達特異性。

針對單細胞測序數(shù)據分析時的reads數(shù)、基因表達量及細胞數(shù)量判定過程中：以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準，每個細胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個細胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細胞類型，例如成熟的B，T，粒細胞數(shù)量較多的組織中，由于該類型細胞表達的基因數(shù)普遍較少，導致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細胞等，他們的基因表達數(shù)較高，甚至可以超過1W，這就導致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此，我們對細胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認時，需要考察實際組織的細胞組成。全線搭建10X Genomics Chromium Controller單細胞測序平臺。

對于單細胞測序而言，常常需要先構建細胞圖譜，在此基礎上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特別是目的為圖譜研究時，需要通過提高樣本復雜度（增加樣本數(shù)），盡可能的構建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此，單細胞測序實驗設計時首先需要保證生物學重復，不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序，以保證捕獲到足夠的細胞數(shù)，單個樣本分別捕獲細胞時，后續(xù)分析除了整體分析以外，還可以做單樣本分析，保證分析的完備準確性。單細胞多組學測序可識別重要的轉錄因子，進行譜系和發(fā)育追蹤。合肥單細胞測序

烈冰引進國際主流單細胞和空間轉錄組測序平臺，保障細胞精度的前提下提供組織內部精細區(qū)域的空間信息。武漢二代測序單細胞測序百萬通量平臺

單細胞多組學提升見解 基于測序的數(shù)據能夠將彰顯其強大之處，因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息，那么單細胞多組學提供了同一細節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來樣本的真實視圖。烈冰2021年強勢引進的10x Genomics Chromium單細胞平臺能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學準確性，因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。武漢二代測序單細胞測序百萬通量平臺

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