基于10X Next GEM技術,單細胞測序一次實驗可以同時檢測近萬個細胞,可在一個樣本中同時獲3'端mRNA表達譜、如需和免疫組庫(TCR和BCR)的數據進行聯合時,即某些研究還需結合基因的表達譜和V(D)J數據進行復雜組織樣本的是影響免疫應答分析,監測免疫療法的效果,研究疾病發生、發展的分子機制,可進行單細胞免疫組庫測序: 烈冰單細胞免疫組庫平臺具備:1000+項目經驗,一次實驗可同時獲取1000-20000個細胞的文庫構建,獲得轉錄組和免疫組數據; 具備完善的免疫組庫測序和實驗質控流程,獲取V(D)J全長序列的配對信息;豐富的免疫組庫測序和數據分析經驗,實現專屬個性化數據分析服務,搭配單細胞分析云平臺,一鍵導出交互性的動態結果報告。烈冰生物全轉錄組測序通過雙文庫構建,實現多種RNA的一網打盡。重慶10X單細胞測序服務公司
單細胞多組學帶來的突破 單細胞測序方法不但改進了實驗過程,還幫助科學家在健康和疾病研究的關鍵領域取得新進展。那些過去從轉錄平均值或單項參數讀取中無法獲得的新發現正在改變我們對傳染病、神經退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態,到揭開疾病用藥應答和耐藥的潛在機制,單細胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學和醫療。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統,曾經模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數,而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。武漢10X Chromium X單細胞測序多組學測序烈冰生物首批引進 Chromium X 平臺,開啟百萬級通量單細胞測序新時代。
二代測序技術在測序方法上取得了重大突破,基于“邊合成邊測序”(sequencing by synthesis)和大規模平行測序技術(massive parallel analysis,MPS),使測序通量和讀取速度得到極大提升,例如Illumina Solexa測序儀。Illumina的測序原理可以簡化為四步:樣品文庫構建、簇生成、測序和數據分析。由于讀長限制,樣品DNA或由RNA逆轉錄得到的cDNA需要被打斷成300-500bp的片段,并在3'和5'端接上3種序列:1)Index,用于區分樣品來源;2)Adapter,用于結合測序通道上的位點;3)Primer binding site,用于結合PCR引物啟動擴增反應。
關于單細胞測序實驗樣本制備,這與流式細胞術用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機械消化、細胞分選或其他細胞分離技術從整個樣本中制備生成活的單細胞懸液。隨后是細胞計數和質量控制步驟,以確保您的樣本有適當濃度的活細胞,并且不含細胞團塊和死細胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進行染色,標記細胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據您的起始材料和實驗目標而定。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質量、樣本豐度、細胞大小,以及是否需要提取出細胞核進行染色質可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生成高質量的單細胞懸液。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。
關于10X Genomics單細胞平臺的樣本類型和樣本制備 :10X平臺在上機前需要注意細胞消化后的細胞團塊,獲得分離良好的細胞懸液、無細胞隨便、極少的細胞團塊,且細胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細胞的大小范圍也很重要。細胞大小通常與細胞表達的轉錄本數量有關。各種尺寸不同的細胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達解決方案中使用的10X Genomics平臺兼容。一般來說,細胞制備方案將根據組織來源和細胞類型而變化。每種組織類型都是獨特的,因此,必須在開始任何單細胞實驗之前優化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細胞懸液,烈冰將盡可能提供技術及實驗上的幫助。單細胞多組學測序可識別重要的轉錄因子,進行譜系和發育追蹤。南昌10X Genomics單細胞測序
烈冰引進國際主流單細胞和空間轉錄組測序平臺,保障細胞精度的前提下提供組織內部精細區域的空間信息。重慶10X單細胞測序服務公司
現有的單細胞測序技術陣營在幾個主要領域存在差別。一個是分隔單個細胞以在其中進行微反應的物理平臺。在這個空間,單個細胞的內容物釋放,轉錄本或其他生物分析物被標記或添加索引,以便下游識別。現有技術的另一個主要區別是如何添加索引,就像生成測序文庫所涉及的流程步驟一樣。10X Genomics單細胞測序平臺采用動態微流控技(Drop-Seq具有類似的技術原理)。從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠,其中一列縱向孔道輸入細胞,凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上,并通過微流控技術,將之輸入到第二縱向孔道,即油相孔道中。這時候,就形成了一個個油滴并輸出并收集在EP管中。每一個油滴中會落入一個細胞以及一個凝膠微珠,那么在每一個凝膠微珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,構成我們的捕獲凝膠微珠。而這個凝膠微珠抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構建文庫。重慶10X單細胞測序服務公司
上海烈冰生物醫藥科技有限公司坐落在江月路999號奇亞特中心22幢,是一家專業的生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】公司。目前我公司在職員工以90后為主,是一個有活力有能力有創新精神的團隊。公司以誠信為本,業務領域涵蓋單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,我們本著對客戶負責,對員工負責,更是對公司發展負責的態度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司憑著雄厚的技術力量、飽滿的工作態度、扎實的工作作風、良好的職業道德,樹立了良好的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序形象,贏得了社會各界的信任和認可。