機體為響應(yīng)各種應(yīng)激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時，往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細胞狀態(tài)。擬時序分析，即根據(jù)不同細胞亞群基因表達量隨時間的變化情況，構(gòu)建細胞譜系發(fā)育，但這里的時間并不是真時間，而是一個虛擬的時間，是指的細胞與細胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中，也會存在多種不同的細胞形態(tài)。因此，不論測定了多少樣本，我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細胞轉(zhuǎn)化和變化進行描述。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。廈門scRNA單細胞多組學測序

烈冰生物搭建近10臺BD Rhapsody平臺，目前為全國范圍內(nèi)的高校、醫(yī)院和研究所等單位的科研學者提供服務(wù)，BD Rhapsody平臺采用U型微孔板，1個板即對應(yīng)1個樣本（不混樣的情況下），每個通道一般捕獲細胞數(shù)在1000-10000個之間，而上限可捕獲40000細胞時也能獲得較低的雙細胞率，此外，單個細胞捕獲效率高達80%，可準確鑒別稀有細胞類型，有利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究；細胞可適性高，對細胞大小（直徑超過40um細胞需要制備成細胞核）及類型無限制。細胞捕獲周期較短，能夠?qū)崿F(xiàn)自動分離，且實驗端捕獲細胞過程全程可視化進行，保障每一例珍貴樣本實驗的成功進行，1天內(nèi)可完成從細胞懸液到cDNA文庫構(gòu)建的所有的測序準備工作。濟南BD Rhapsody單細胞測序服務(wù)公司對于消化背景雜，樣本初始數(shù)量少，關(guān)注粒細胞的項目，推薦您使用烈冰BD 單細胞測序平臺。

多樣本數(shù)據(jù)合并：Fraction of Reads Kept：合并樣本時，各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平，從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數(shù)量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù)，深度解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果，深入挖掘其背后的生物學意義；從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細胞研究，加速科研進程！

由于高通量測序?qū)嶒灧椒ㄏ嚓P(guān)的測序成本，使得單細胞實驗往往非常昂貴，烈冰生物BD Rhapsody單細胞測序服務(wù)珍視您的每一份樣本，在平臺搭建前，我們測試評估了BD Rhapsody的性能，與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來看，將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序（每個細胞月8700個讀數(shù)）。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下，每個細胞中，來自每個細胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測為人或小鼠，這表明微孔之間的串擾非常小，在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下，多重態(tài)發(fā)生率接近零，并且在15000個細胞下小于5%。烈冰BD Rahpsody單細胞測序平臺，助力您的深入科學探究。

單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。自2019年起，烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。廣州BD VDJ單細胞實驗服務(wù)

單細胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰BD 單細胞測序服務(wù)讓您的醫(yī)學研究如虎添翼。廈門scRNA單細胞多組學測序

對于稀有樣本，或細胞量比較少的稀有組織，樣本中每一粒細胞都很珍貴，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對該種類型的樣本能實現(xiàn)友好包容，如果在實際實驗中，我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。也會和您探討是否考慮去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物的操作，以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因為，死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲，并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當樣本活性較差時，對細胞懸液中細胞活性檢測后，需要進行一般死細胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時考慮此操作），以保證較高的上機捕獲細胞的質(zhì)量。廈門scRNA單細胞多組學測序

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