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西安BD單細胞實驗平臺

來源: 發布時間:2022-07-08

烈冰生物為您的實驗定制工作流程: 對于不同用戶和實驗,單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質量和通量。BD儀器選項可以根據具體需求進行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺(如 BD FACSMelody),是上游樣本富集的良好選擇。此外,我們具備BD Rhapsody單細胞成像儀提供自動化細胞計數和細胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細胞的計數。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜,可在實驗室內輕松移動。搭配烈冰傾情研發多年的成果NovelBrain生物信息大數據分析系統,完成測序數據的生物信息分析和結果可視化呈現。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經驗的用戶也可分析和理解單細胞數據。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細胞測序服務。西安BD單細胞實驗平臺

針對單細胞測序的細胞上樣數,為什么不建議捕獲到的細胞數量越高越好?一味地追求高數量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標細胞捕獲數增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質量不是很理想(細胞活性<90%、碎片率>5%、結團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結果不理想的直接體現包括:cell、non-cell無法有效區分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區分時,會使得數據出現假陽性和假陰性結果!當目標細胞捕獲數很大時,多細胞率會增加,數據分析時,此部分“cell”表現為基因檢測數和UMI檢測數是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數),導致所有細胞的統計數據(單個細胞基因檢測中位數、單個細胞UMI檢測中位數)虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數據分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數據的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!西安scRNA單細胞測序烈冰測序服務已助力300余篇國際期刊研究文章發表。

烈冰科技作為國內率先同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰總結搭建出不同的數據預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫療健康等領域對大數據分析的需求。高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等,配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。

烈冰與國內高校、研究所、醫院和藥企單位開展深度合作,服務于600+臨床與研究機構,1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯合發表300+篇CNS等國際學術期刊(不完全統計),在單細胞領域,烈冰助力用戶發表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領域國際主流學術期刊,已發表文章研究領域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發生轉移機制,免疫研究、腦神經、白血病、胚胎發育、糖尿病、退行性疾病和植物領域研究等。從樣本處理到終端數據分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務。

針對單細胞測序數據分析時的reads數、基因表達量及細胞數量判定過程中:以捕獲5000個細胞、100G的測序量為標準,每個細胞的reads數大約在50k左右;每個細胞的基因中位數取決于樣本的細胞類型,例如成熟的B,T,粒細胞數量較多的組織中,由于該類型細胞表達的基因數普遍較少,導致基因中位數下降。而某些疾病組織、或者體外培養的如干細胞等,他們的基因表達數較高,甚至可以超過1W,這就導致該類樣本基因中位數非常高。因此,我們對細胞數量以及基因中位數確認時,需要考察實際組織的細胞組成。烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細胞測序服務。西安BD單細胞實驗服務

BD單細胞測序平臺同時兼容單細胞蛋白組測序(Ab-seq)和免疫組庫測序等工作。西安BD單細胞實驗平臺

烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,針對龐大的單細胞測序數據,能夠實現細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入gene list構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節寬、高和系數比例來調節美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節省工作時間并提升整體工作效率。西安BD單細胞實驗平臺

上海烈冰生物醫藥科技有限公司是一家生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】的公司,致力于發展為創新務實、誠實可信的企業。烈冰生物深耕行業多年,始終以客戶的需求為向導,為客戶提供***的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物繼續堅定不移地走高質量發展道路,既要實現基本面穩定增長,又要聚焦關鍵領域,實現轉型再突破。烈冰生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執著使烈冰生物在行業的從容而自信。

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