所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計(jì)的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號(hào),獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時(shí)具有明顯的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個(gè)系統(tǒng)的工程,開展項(xiàng)目前您可能會(huì)先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實(shí)驗(yàn)過程如何規(guī)劃,實(shí)驗(yàn)平臺(tái)如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實(shí)驗(yàn)到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項(xiàng)目訴求,提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)到文章發(fā)表的全流程,我們始終是您貼心的科學(xué)合作伙伴。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn),烈冰配套全程個(gè)性化、定制化地?cái)?shù)據(jù)分析服務(wù)。無錫scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,BD平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量,特殊研究需求的項(xiàng)目,可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量(單個(gè)樣本)。這個(gè)量級(jí)的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,都會(huì)更實(shí)用。此外針對特殊項(xiàng)目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺(tái)也有更好的捕獲效能,滿足您的實(shí)際需求。合肥單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)BD 單細(xì)胞捕獲平臺(tái)搭配BD Scanner,全流程實(shí)時(shí)質(zhì)控,項(xiàng)目質(zhì)量盡在掌握。
科研的魅力之處,在于無窮盡的探尋生命的本底,通過單細(xì)胞測序,我們對組織的分子基礎(chǔ)的研究也從初級(jí)到深層,并在單細(xì)胞層面逐漸達(dá)成一致,那么不禁要問一句,組織的空間位置到底重不重要?空間異質(zhì)性是功能的關(guān)鍵特征,細(xì)胞的位置信息更能反應(yīng)細(xì)胞命運(yùn)調(diào)控機(jī)制和細(xì)胞譜系發(fā)生過程。因此時(shí)間和空間即像組織的AB面,而不可否認(rèn)的是,此時(shí)空間坐標(biāo)的記錄,像一個(gè)還未長大的娃娃,雖未觸及分子基礎(chǔ)研究的深層,但仍在努力攀登探尋生命本底的下一個(gè)高峰。
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。十二年測序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。
現(xiàn)有的單細(xì)胞測序技術(shù)陣營在幾個(gè)主要領(lǐng)域存在差別。一個(gè)是基于微流控通道的細(xì)胞與Beads的在通道內(nèi)的動(dòng)態(tài)結(jié)合,通過油相水相不相容的特點(diǎn)將結(jié)合了的細(xì)胞和Beads進(jìn)行分隔,在這個(gè)空間,單個(gè)細(xì)胞的內(nèi)容物釋放,轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引,以便下游識(shí)別。BD Rhapsody單細(xì)胞測序平臺(tái)采用靜態(tài)微孔技術(shù)(Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理)。通過微孔板的物理分隔,將一個(gè)個(gè)單個(gè)細(xì)胞和帶有標(biāo)簽的磁珠,一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺(tái)中。這樣,每一個(gè)細(xì)胞都會(huì)結(jié)合一個(gè)磁珠,那么在每一個(gè)磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,這個(gè)抓手就會(huì)使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。深度的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時(shí)代。BD Rhapsody單細(xì)胞
烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺(tái),助力您的深入科學(xué)探究。無錫scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)
烈冰生信團(tuán)隊(duì)傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺(tái),針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個(gè)性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺(tái)上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊(duì)和自主分析用戶實(shí)現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動(dòng)化分析,節(jié)省工作時(shí)間并提升整體工作效率。無錫scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。烈冰生物是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),一直“以人為本,服務(wù)于社會(huì)”的經(jīng)營理念;“誠守信譽(yù),持續(xù)發(fā)展”的質(zhì)量方針。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),具有單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。烈冰生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。