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BD VDJ單細胞多組學測序

來源: 發布時間:2022-07-09

針對BD Rhapsody單細胞捕獲平臺,烈冰生物提供專業的優化試劑和專業知識:BD Rhapsody試劑是轉為 Rhapsody 系統設計,旦性能已得到驗證的產品,因此研究人員可以專注于解決生物學問題,而不必花費時間應對多組學分析的技術障礙。此外,我們還提基于BD平臺的單細胞多組學服務,如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細胞分析中得到充分研究,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對生物學系統的理解。作為BD中國單細胞聯合實驗室的合作伙伴,我們將繼續擴展檢測試劑盒和試劑產品組合的范圍,以支持前沿多組學分析。我們經驗豐富的專業客戶服務團隊可在多組學分析的各個方面為您提供幫助。BD單細胞測序平臺同時兼容單細胞蛋白組測序(Ab-seq)和免疫組庫測序等工作。BD VDJ單細胞多組學測序

對于單細胞測序而言,常常需要先構建細胞圖譜,在此基礎上再開展后續各項分析,并且數據分析時以細胞聚類(cell cluster)為討論對象,而不是像常規Bulk測序一樣以組別為分析對象,因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格,但是單細胞測序,特別是目的為圖譜研究時,需要通過提高樣本復雜度(增加樣本數),盡可能的構建某一疾病類型、群體細胞圖譜信息。因此,單細胞測序實驗設計時首先需要保證生物學重復,不同樣本來源的樣本建議單獨進行細胞解離和捕獲、建庫、測序,以保證捕獲到足夠的細胞數,單個樣本分別捕獲細胞時,后續分析除了整體分析以外,還可以做單樣本分析,保證分析的完備準確性。烈冰生物單細胞轉錄組測序附加流式分選細胞表面Marker,對于較低分辨率的標志物也能有效鑒定,助力高要求測序項目。

由于高通量測序實驗方法相關的測序成本,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細胞測序服務珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數據結合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數)。在測序數據中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,來自每個細胞的平均99.4%的分子經檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數據中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,多重態發生率接近零,并且在15000個細胞下小于5%。

基于測序的數據能夠將彰顯其強大之處,因為它能夠了解同一單細胞的多種生物分析指標。如果說單細胞基因表達提供了一種顏色的詳細信息,那么單細胞多組學提供了同一細節的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BD Rhapsody單細胞平臺以來,能夠從同一單細胞中讀取細胞復雜性的多組學特征。與傳統方法不同,單細胞多組學簡化了您需要開展的實驗,也節省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結果。這不但節省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學準確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數據集并通過計算來推斷各個組學之間的關系。從樣本處理到終端數據分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務。

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業,為科研學者提供專注的測序數據分析服務,先后經歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來,單細胞測序進入發展的快車道,烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發的NovelBrain?生物大數據分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細胞類型,1000+靶標基因,10000+樣本處理經驗。測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。武漢BD VDJ單細胞多組學測序

單細胞測序技術的迅速發展和應用推廣,為從多維度揭示疾病發展提供了強有力的工具。BD VDJ單細胞多組學測序

烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細胞懸液:可使用碧迪醫療單細胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯抗體( Ab-Oligos)將細胞染色 2.微孔板預充和處理:使用自動移液器進行液體交換 3.單細胞捕獲工作流程: (1)細胞上樣:上樣 575微升細胞懸液;系統未采用微流體通道設計,無需擔心通道堵寨;通過重力輕輕沉淀細胞,可捕獲脆弱細胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區,可在低雙細胞率下捕獲多達40000個細胞 (2)細胞上樣掃描:估算捕獲的活細胞數量和細胞多態率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中 (4)磁珠上樣和磁珠洗滌掃描:估算包含活細胞和磁珠的微孔數量;測定細胞存留率,評估是否發生細胞損失 (5)細胞裂解:使用裂解緩沖液,確保細胞完全裂解 (6)磁珠回收:輕松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner掃描磁珠回收情況BD VDJ單細胞多組學測序

上海烈冰生物醫藥科技有限公司屬于醫藥健康的高新企業,技術力量雄厚。烈冰生物是一家有限責任公司(自然)企業,一直“以人為本,服務于社會”的經營理念;“誠守信譽,持續發展”的質量方針。以滿足顧客要求為己任;以顧客永遠滿意為標準;以保持行業優先為目標,提供***的單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物自成立以來,一直堅持走正規化、專業化路線,得到了廣大客戶及社會各界的普遍認可與大力支持。

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