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單細胞測序方法不但改進了實驗過程,還幫助科學家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認識。從鑒定新的細胞類型和狀態(tài),到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機制,單細胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定。武漢BD單細胞實驗平臺
單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。廈門BD單細胞服務(wù)機構(gòu)個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。
BD Rhapsody單細胞轉(zhuǎn)錄組測序是利用單細胞水平上的高通量測序分析基因表達譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性,針對多種組織類型的樣本,采用BD 細胞懸液制備protocol組織解離后,單個樣本一次上機能捕獲500-10000個細胞, 基于每個細胞分別建庫測序,獲得單個細胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達狀態(tài),并鑒定細胞的類型,可以在不同樣本間從細胞類型的組成和豐度角度進行比較,反映細胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測定法以滿足多種實驗需要,并有效縮短實驗是時間和降低測序成本。
什么時候要用到去死細胞的操作呢?跟進烈冰生物多年單細胞測序服務(wù)經(jīng)驗來看,當細胞懸液進行質(zhì)量和活性檢測后,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,可能已經(jīng)丟失了原組織內(nèi)的細胞比例和狀態(tài),失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,保證數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和實驗結(jié)果的準確性。但需要注意到,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數(shù)量,因此希望您在提供樣本時,盡可能提供足量的細胞,以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低,一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。
單細胞測序技術(shù)(Single Cell Sequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在樣本中細胞的異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領(lǐng)域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了Bulk Population Sequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領(lǐng)域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設(shè)備,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的準確質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BD Rhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結(jié)果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關(guān)鍵關(guān)卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領(lǐng)域收獲更多的成果。烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。杭州BD單細胞轉(zhuǎn)錄組測序
單細胞測序因其強大的探究疾病--細胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的“天花板”。武漢BD單細胞實驗平臺
單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,100+組織類型解離protocol,精心設(shè)計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術(shù)以及死細胞過濾技術(shù),確保凍存組織使用。 珍貴樣本,細胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細胞? 采用國際認可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺模式,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。 單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分? 烈冰同時采用單細胞蛋白質(zhì)組與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),真正做到從上游到下游的全流程檢測,確保超高的細胞分類精度。武漢BD單細胞實驗平臺
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶的需求為向?qū)В瑸榭蛻籼峁?**的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱,始終關(guān)注客戶,創(chuàng)新科技,竭誠為客戶提供良好的服務(wù)。