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廈門single cell RNA單細胞多組學測序

來源: 發布時間:2022-07-14

什么時候要用到去死細胞的操作呢?跟進烈冰生物多年單細胞測序服務經驗來看,當細胞懸液進行質量和活性檢測后,考慮對細胞活性在50%-70%的懸液進行去除死細胞的操作。而太低活性的懸液(小于30%),懸液中細胞大量死亡,可能已經丟失了原組織內的細胞比例和狀態,失真嚴重,建議重新收集樣本進行新的實驗,保證數據的高質量和實驗結果的準確性。但需要注意到,去除死細胞的操作會損失一定的細胞數量,因此希望您在提供樣本時,盡可能提供足量的細胞,以備實驗過程中可能存在的細胞死亡的問題,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對樣本起始細胞量的要求較低,一般提供10萬個細胞以上均可滿足需求,特殊樣本可詳細咨詢烈冰生物。烈冰生物作為BD 中國聯合成立單細胞測序實驗室,為推動單細胞測序技術發展貢獻中國力量。廈門single cell RNA單細胞多組學測序

所謂的高通量測序技術,又名大規模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數以萬計的克隆(colony)進行延伸反應,檢測對應的信號,獲取序列信息。與傳統測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術在處理大規模樣品時具有明顯的優勢,又快(兩天)又多(數百萬克隆),成為目前組學研究的主要技術。單細胞測序是一個系統的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數據如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務就已經開始了,從銷售到實驗到專業技術支持,我們開通全線對接渠道,幫助您快速定位項目訴求,提供從實驗設計到文章發表的全流程,我們始終是您貼心的科學合作伙伴。寧波single cell RNA單細胞測序服務公司烈冰科技成立10余年,為科研學者提供專注的測序數據分析服務。

烈冰生物單細胞測序服務體系,不僅提供10X Genomics和BD Rhapsody兩大國際認可的單細胞實驗平臺,在“附加”產品上,我們提供BD FACS Melody流式細胞儀,滿足您對特殊細胞類型的富集需求,自主研發的Panocell單細胞捕獲芯片,可兼容BD 平臺全套原裝磁珠、試劑和protocol,為您提供完整的單細胞多組學解決方案。從細胞多樣本分析和染色所需的試劑到檢測試劑盒,生物信息分析工具,和在線大數據分析系統、精簡方案和專業團隊技術支持,烈冰生物可為您提供用于單細胞多組學甚至到空間轉錄組測序的各種工具,助您加速科研探索之旅。

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數據集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫序列(包括T細胞和B細胞受體)以及用于了解表觀基因組調控的開放染色質區域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數據,研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產力、減少因批次效應引起的錯誤,并節省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。BD Rhapsody平臺在細胞捕獲過程中沒有偏好性,可同樣無差別捕獲中性粒細胞。

單細胞測序龐大的數據烈冰生信團隊傾情研發的NovelBrain?生信大數據分析平臺,可實現零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數,UMI數量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。從樣本處理到終端數據分析,只要您需要,烈冰提供全流程的無憂服務。北京BD單細胞平臺

測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。廈門single cell RNA單細胞多組學測序

烈冰生物搭建近10臺BD Rhapsody平臺,目前為全國范圍內的高校、醫院和研究所等單位的科研學者提供服務,BD Rhapsody平臺采用U型微孔板,1個板即對應1個樣本(不混樣的情況下),每個通道一般捕獲細胞數在1000-10000個之間,而上限可捕獲40000細胞時也能獲得較低的雙細胞率,此外,單個細胞捕獲效率高達80%,可準確鑒別稀有細胞類型,有利于稀有樣本或小細胞量類型樣本研究;細胞可適性高,對細胞大小(直徑超過40um細胞需要制備成細胞核)及類型無限制。細胞捕獲周期較短,能夠實現自動分離,且實驗端捕獲細胞過程全程可視化進行,保障每一例珍貴樣本實驗的成功進行,1天內可完成從細胞懸液到cDNA文庫構建的所有的測序準備工作。廈門single cell RNA單細胞多組學測序

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